Последние комментарии

  • 9 часов 3 минуты назад
    Автор: А.П. Тюрин

    Азитромицин имеет весьма специфическую ФК/ФД и накапливается в некоторых типах иммунных клеток специфично. На все макролиды я бы это не распространял.

    Недавно наталкивался и на данные, что гликопептиды (типа ванкомицина) тоже могут быть ингибиторами некоторых вирусов.

    Это примерно как та история, что пенициллин применяют при отравлениях грибами (конкурентно связывается с каким-то из ферментов печени и "смягчает удар"). Сложные природные и полусинтетические соединения и ведут себя довольно затейливо. А уж в живом-то организме - без эксперимента, на одних "общих соображениях",  тут далеко не уйдешь.

  • 9 часов 29 минут назад
    Автор: А.П. Тюрин

    Если посчитать, то получается 25*12 = 300 тыр/год на зарплату + 150 тыр налоги и взносы. Т.е. минимум 900 тысяч из 1200 уйдут на зарплату/налоги. Остается 300 на два года. Как-то негусто для экспериментальной работы, особенно, если это действительно самостоятельный проект, как того хочет РФФИ. А если еще организация захочет "отщипнуть"? Думаю, размер гранта должен быть увеличен для экспериментальных работ. И для работ, требующих организации экспедиций.

    Потом, большая часть организаций, чтобы поучаствовать в конкурсе, досрочно аттестовала аспирантов 1 года и перевела их на следующий год. Зачем все эти манипуляции? Не проще ли разрешить участвовать всем аспирантам, любых годов (если последнего - то можно сократить его размер, требования и сроки, но повысить входные требования, а для первого года - наоборот)?

  • 19 часов 50 минут назад
    Автор: А.Л. Фрадков

    В 2019 г  в конкурсе аспирантов РФФИ выиграли 1500 аспирантов.

    Если кто-то участвовал, то что понравилось, что не понравилось, что изменить надо?

    Начальство просит сообщить до  4 апреля для передачи в РФФИ.

  • 2 дня 14 часов назад

    врач-терапевт  в  данном     случае  тот  еще  источник  информации.  Но    думаю,  что  пока  еще  не  набрано  данных  по структуре    этого     вируса  -  особенно  в  сравнительном  анализе   вирусов       от  пациентов с  легкой   и  летальной   формами  заболевания    одного    возраста. 

  • 2 дня 16 часов назад
    Комментарий: По мутациям.
    Автор: C.П. Полютов

    По мутациям.

    1) каждый акт репликации- мутация.

    https://m.gazeta.ru/social/news/2020/03/30/n_14227369.shtml

    2) мутирует медленнее гриппа.
    https://ria.ru/20200329/1569315712.html

  • 2 дня 16 часов назад
    Комментарий: Понятно, спасибо
    Автор: C.П. Полютов

    Да, это понятно, что сильно летальный будет подавляться смертью хозяина. Но, опять-таки, на больших временах. А локально, без карантина, очевидно, зацепить может все-равно большие группы населения. Для распространения достаточно одной-двух передач вируса до смерти хозяина.

    Насчёт мутаций информация пока-что противоречивая. Есть и исследования, в которых говорится о том, что у коронавируса, наоборот, мутаций меньше чем у гриппа. От этого, конечно, сильно все зависит. Если мутаций мало, то ситуация более прогнозируемая, но не факт, что конечный результат будет лучше.

  • 2 дня 16 часов назад

    Главное  -     вирус  с  высокой  патогенностью  будет  размножаться  в  популяции  хуже.   

    Насчет    мутировании  при кажом акте  репликации  -   перебор,     хотя  мутирует   быстро.  Перебрать все      сложно  -  хотя   эволюция   быстрая, от  момента    заражения  до   первой   клиники   проходит  4-5   дней,  а  где-то  с  3  дня  можно  заражать      людей   вокруг.   В  итоге  за  месяц  прохиодит   около  10   передач   вируса  от   хозяина  к   хозяину.  Плюс   есть  еще   эволюция  внутри   организма  пациента  -  разные  клетки  эпителия   могут   быть  поражены   разными   вариантами  вируса в  результате  мутаций.  И   опять  же   те,  которые    сильно  поражают  эпителий  и  убивают  его  -    вымирают. 

  • 2 дня 16 часов назад
    Комментарий: Мутации
    Автор: C.П. Полютов

    Логика понятна, хотя тут много "но" и предположений. В частности предположение, что человек с летальным вирусом сразу попал в стационар- у него есть симптомы, он социально ответственный и нигде не лазил, а медицинская система идеальна и его сразу взяла в оборот.

    Вчера прошла информация, что вирус мутирует при каждом акте репликации, что делает его уникальным. Если это так, то вирус достаточно быстро,может быть за пару месяцев, переберет все эволюционные комбинации, причем за 2 месяца, вероятно, не единожды. Какое у него там время репликации? В том числе появится и вирус с максимальной летальностью, и с долгим бессимптомным, но заразным, инкубационным периодом. Будет и такой, который максимально приспособлен к сосуществованию с человеком. Ну и промежуточные варианты, которые мы, вероятно, пока-что наблюдаем.

    Понятно, что это на уровне общих рассуждений, но тем не менее...

  • 2 дня 17 часов назад

    Есть   исходный   вирус   -    вариант  А.  Пациент с   этим  вирусом    заразил  двух   человек    двумя  мутантными вариантами  исходной   формы  -     сильно  патогенным  и  слабо  патогенным,  В    и  С.  Человек  с  сильно  патогенным  вариантом   В  быстро  попал  в  стационар   и  никого    по  дороге  не   заразил.  Или   заразил   пару  человек.  Вариант  С  вызывает  только   легкий  кашель.   В    итоге      этот     клиент    заразил  сам  того  не  ведая    много  человек.   В    итоге   в     общей  популяции    вируса  произошел   сдвиг в  сторону   менее  патогенного  варианта. 

  • 2 дня 18 часов назад
    Автор: C.П. Полютов

    "в популяции выживают, в основном, те мутации, которые приводят к росту выживаемости организма".

    Я предполагаю, что это происходит, но только на длительных временах, именно поэтому и написал выше "во время пандемии", то есть локально во времени, и что у вируса мозгов нет. Локально во времени может произойти что угодно, в том числе и более летальные мутации. А чтобы всем заразиться нужно всего 1.5 месяца на данный момент и при имеющейся динамике. Вряд ли следует ожидать за такое короткое время снижения патогенности. Вероятно потом патогенность снизится, среди тех, кто останется. Группе риска, на мой взгляд, нужно полностью (!) изолироваться чтобы дождаться этого времени, когда патогенность снизится (если). 

    Будем надеяться на лучшее, хотя пока-что оснований для этого нет.

  • 2 дня 19 часов назад

    "Но оснований считать, что мутации приводят к снижению патогенности в данном случае вроде как нет никаких."

    Меня тоже это смущает. Согласно законам эволюции (читаем "Логику случая" Евгения Кунина) в популяции выживают, в основном, те мутации, которые приводят к росту выживаемости организма. Правда, согласно тому же автору, могут выживать и плохие мутации, если за время их жизни случится хорошая. В любом случае живучесть должна возрастать, а не убывать. К сожалению, выяснить этот момент не могу.

  • 2 дня 20 часов назад
    Автор: C.П. Полютов

    Это на уровне "хотелок". Этот вирус, действительно, очень быстро мутирует, вроде бы некоторые медики говорят, что у него мутации при каждом (!) цикле размножения. Отсюда гигантское число штаммов. Но оснований считать, что мутации приводят к снижению патогенности в данном случае вроде как нет никаких. Мозгов у вируса нет и у него нет цели адаптироваться к "хозяину". Какие механизмы при пандемии помогут вирусу адаптироваться так, чтобы не убивать хозяина? Ключевое слово- во время пандемии. 

    На данный момент нет также особых оснований считать, что формула "удвоение за 3 дня" не будет работать- она во всех странах работает и пока-что не меняется. Исключение- Китай, там они вышли на плато в графике числа заболевших (новые случаи, как они утверждают, все "завозные"). Но можно ли этому доверять? 

  • 2 дня 23 часа назад

    при терапии вирусных пневмоний. Вопреки мнению некоторых медиков, что антибиотки при вирусных инфекциях вредны.. Наблюдали снижение вирусной нагрузки и при использовании макродидов при РРСС у свиней (возможно, следующий кандидат на межвидовой переход).  Однако там это может быть связано с подавлением макрофагов. Не следует ли что коронавирус тоже активно размножается в макрофагах легких? 

  • 2 дня 23 часа назад

    сроки когда карантин станет излишним? Допустим в Италии мы имеем 50% инфицированность. Большая часть жителей в условиях самоизоляции уже заражены и являются бессимптомными носителями. Наблюдаемый прирост заболеваемости это, в таком случае, будет лишь процесс манифестации/генерализации инфекции. Важно вовремя убрать карантин чтобы угробленная экономика не задушила медицину. Кто-то из грамотных в математике людей может это сделать?

  • 2 дня 23 часа назад

    это же холодовая цепь нужна. Взял пробирку с ферментом в глицерине в руку, погрел теплом тела и нету фермента.. Днк полимераза еще худо бедно держит, с РНК полимеразой все сложно. Даже мы в Новосибирске стараемся работать с местными ферментами т.к. очень часто просто не довозят, даже из Москвы.. массовое тестирование населения по стране в целом уже не нужна. Вот в благополучных регионах можно было бы наладить такую работу, подогнать мобильные пцр лаборатории, перебросить персонал и изолировать эти регионы от притока инфицированных людей, отслеживать инфицированных и контактных с ними людей т.е. делать в микромасштабе на уровне регионов, отдельных населенных пунктов то, что сделали сингапур, южная корея и китай. География нашей страны позволяет добится успеха. Уровень развития пцр диагностики у нас не плох, мы даже скорее опережаем среднемировой уровень и надо этим пользоватся. 

    Надо забить болт на сертификацию - акредитацию, вернуть право на работу со второй группой тем лабораториям у которых это право забрали (2019 год как раз роспотребнадзор зачищал всякие инфекционные лаборатории, институты, сокращал персонал и т.д.). Важно ведь не гипердиагностика а избежать недовыявления носителей. Лучше проводить плохую пцр диагностику чем никакую..Например, наш ветеринарный НИИ может делать 600 тестов в день.  Я не думаю что мой 20 летний опыт в этой области так уж плох. Пробы должны брать все кто работает непосредственно с людьми и сам может заразится а не ездить всякие дяди пытаясь объять необъятное. Может пусть люди сами берут пробы, пакуют в пакеты и выкладывают в какой-нибудь контейнер на улице. 

    Можно создавать локальные зоны с минимальным риском заражения для пожилых людей, групп риска, достойных людей (во всяких санаториях и деревнях). Затем ПЦР исследования важны для оценке эффективности мероприятий, схем лечения, препаратов. Собственно это самое важное сейчас. Все усилия по задержке распространения инфекции, повторюсь, нужны чтобы понять как лечить и снизить смертность. То что РФ не самая первая страна по уровню заражений уже дает нам хороший шанс т.к. накопился опыт лечения.

     

  • 3 дня 22 минуты назад
    Комментарий: как мне это знакомо..

    с чего начиналось подыхание 99% индейки от не описанного толком до сих пор флавивируса..? Сначала оно дехло чуть больше норматива, потом выдох птичник на 20% потом на 60% а потом за три дня вымерло 99% с копейками. Позвали меня. Было интересно, да.  Или вот некий очень крупный свинарник - гора трупов высотой более 3 метров (кранбалкой поднимали наверх для компактности) в течение пары лет смертность устойчиво держалась на уровне 40-60% т.е. общая смертность а заболеваемость была более 80%. На первый взгляд очень все хорошо в плане биозащиты (несопоставимо лучше в сравнении с поселениями людей и больницами). Но это все очень крупные хозяйства т.е. многие сотни тысяч голов сконцентрированные в одном месте. Обычно очередной вирус растаскивается за считанные месяцы несмотря на реально хорошие меры по биозащите (люди моются. корма стерилизуют, вакцинации поголовные и т.д.) . Более того, в РФ требования по обеспечению биобезопасности строже чем в ЕС, у нас чище на предприятиях, более современное оборудование, хорошо оснащенные лаборатории, врачи которые много учатся в РФ и за рубежом. Помощь Ервопейской науке и хорошая интегрированность с международной практикой и т.д.  Вроде бы и не должны были заражатся..

    1. С поиском новых инфекций у нас большие проблемы,  нет никакой экономической, политической и психологической мотивации искать чтото новое. Это так и в медицине и в ветеринарии. за это вообще-то наказывают. 

    2. можно залить деньгами город или свинарник но это не поможет если ты не знаешь что нужно делать потому что проблема новая.. Единственное что дает сейчас карантин и прочие противоэпидемические мероприятия при CoVID19 это дать время нам, ученым чтобы мы разобрались и помогли. В РФ так тоже непринято делать. Должны ли ученые РФ и в частности ОНР прилагать усилия?  

    3. есть примеры когда только и исключительно помощь ученых позволяла направить все эти миллионы инвестиций и усилия тысяч специалистов в нужное русло и проблему решить. В ветеринарии у нас это так а у них это очень часто так (там ученые создают аутогенные вакцины быстро и из местных штаммов, ищут новые инфекции и это важнейшие элементы инфекционной безопасности хот в ветеринарии хоть в медицине).

    4. предлагаю обсудить. Один межвидовой переход  CoVID 19. уже был -панголин? и рукокрылые, теперь человек.. кто сказал что нету других видов и особенно близких к человеку? Появление природного резервуара чревато проблемами на долгие годы. Попадание вируса в организм, скажем,свиней или индеек, чревато очень быстрым распространением заразы по всей стране (с менее взрывным возникновением вспышек, скорее равномерно размазанный по стране рост спорадической заболеваемости, может с учетом приоритетности потребления. Если заражена индейка - то Москва пострадает больше, а если свинина то Чечня пострадает меньше, например). Помимо возможного сходства структуры ACEII у разных видов животных есть еще вопрос возможности формирования гибридных вирусных частиц (фенотипическое смешение). Когда РНК одного вируса упаковывается в капсиды другого вируса, с формированием вирусных пулов обеспечивающих размножение в клетках обоих видов. Свиньи, куры телята, индейка все имеют свои коронавирусы, в основном в кишечнике. Попадание человеческого CoVID 19  в условиях высокой концентрации коронавируса в кишечнике, например, индейки, гарантирует попадание в одну и ту же клетку двух вирусов одновременно... Для устойчивого перезаражения нужна существенно более высокая доза заражения т.к. минимальная инфекционная единица это две вирусных частицы с разными РНК (при неравной представленности этих типов у заболевшего.. а это неизбежно т.к. количество гибридных вирусных частиц это производная от количества копий РНК в организме "правильного вируса"). То есть доза заражения должна быть минимум в 10-100 раз выше. С.х. производство, особенно в РФ, Китае и США такие условия создает. Может знакомым математикам за рубежом эту мысль? 

     

  • 3 дня 12 часов назад
    Комментарий: Нельзя так считать

    При передаче вируса между людьми происходит его адаптация к новому организму, и при этом почему-то патогенность снижается. Так что будем надеяться на лучшее.

  • 3 дня 12 часов назад
    Комментарий: О лечении

    Моя родственница, в прошлом врач скорой помощи, прислала из Америки ролик, в котором врач рассказывает о применяемой методике лечения. Вот что я понял.

    Используют комбинацию hydroxychloroquine sulfate (plaquenil, противомалярийный) 200 мг внутрь 3р/д 10 дней + azithromycin внутрь 1 р/д, в первый день 500 мг, следующие 4 дня по 250 мг. График уровня вируса в крови: с приёмом только первого уровень падает до 50% на 6-й день, с приёмом обоих – до нуля на 5-й день.

    Необходима консультация врача, т.к. есть значительные вредные эффекты, так что эта информация - только для специалистов, если у них её ещё нет.

  • 3 дня 12 часов назад
    Комментарий: Если
    Автор: C.П. Полютов

    А если до 15 мая посчитать? Вроде как все на планете заразятся уже к этому времени при такой динамике. Тогда к середине июня все закончится или почти закончится, так или иначе...

  • 3 дня 14 часов назад

    Исследование Михаила Тамма с прогнозами развития эпидемии

    https://meduza.io/feature/2020/03/30/v-moskve-vveli-zhestkie-karantinnye...

  • 3 дня 18 часов назад

    Согласно данным, приведеным на сайте https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries , в последние две недели зависимость числа случаев от времени стала экспоненциальной, см. прикреплённый логарифмический график.

    За две недели число заболевших в мире выросло в 4.3 раза, с 170 до 720 тыс., а число умерших в 5.2 раза, с 6.5 до 34 тыс. Если и дальше так пойдёт, то к середине апреля будет 3 млн заболевших и 180 тыс. умерших. 

  • 3 дня 18 часов назад
    Комментарий: Новый элемент генома

    Завершая неинтересную конспирологическую тему, скажу лишь, что одно не исключает другое: например, шип модифицировали, а точечные мутации возникли позже, в результате естественнеой эволюции.

    Гораздо интереснее находка, что геном covid19 содержит вставку (polybasic cleavage site), которой нет у других подобных вирусов. Назначение её неизвестно. Предполагается, что она возникает при передаче между людьми.

  • 4 дня 37 минут назад
    Комментарий: Ну нет в геноме COVID-19

    следов  генно-инженерных  манипуляций.    Очень  просто  переставить  ген  из     А  в   Б  -    но    сложно  внести  панель  точковых    замен.

  • 4 дня 8 часов назад
    Комментарий: Продолжаю читать

    Они сравнили геномы и шипы у вирусов из летучей мышки и ползучей ящерицы и получили, что мышкин вирус похож на covid19 целым геномом (96%), но отличается шипом и не связывается с человеческим рецептором, а у ящерицы геном другой, зато шип подходящий, и вот поэтому covid19 есть результат естественного отбора - и опять не понял, почему. Казалось бы, бери любой коронавирус и модифицируй его шип, что сделать, как пишут, совсем просто, и вот вам новый враг народа. Ведь вирус убивает не какими-то ядами, а самим фактом своего быстрого размножения в клетке, так что шип (и ген, который кодирует его белки в сайте связывания с рецептором) - это главное его оружие.

    Прошу прощения за эти мало кому интересные подробности. Приятных просмотров роликов на ю-тубе!

  • 4 дня 9 часов назад

    Например, там говорится, что covid19 умеет хорошо связываться с рецептором ACE2 человеческой клетки, как и прежний SARS, но шипы, которые связываются с АСЕ2, у них разные. На этом основании делается вывод, что covid19 имеет естественнеое происхождение. Странная логика!

Страницы

Подписка на Последние комментарии