15
Мар
2020

О коронавирусе

Читайте также: 

Когда весь мир сотрясают страхи, порожденные чумой XXI века - коронавирусом COVID-2019, нельзя на форуме научных работников делать вид, что ничего страшного  не происходит. Конечно, ученых прежде всего интересует мнение ученых, тех, кто может говорить, опираясь на знания, цифры и факты. Хотя физического общения людей в это опасное время лучше избегать, виртуальное общение в киберпространстве может быть и полезным и интересным. Я сам, к сожалению, не специалист, но друзья переслали пару ссылок на достаточно серьезные выступления, которыми я хотел бы поделиться.

Во-первых, разговор 12.03.2020 на "Эхе Москвы" с д.б.н., профессором Сколтеха Георгием Базыкиным, который критически анализирует некоторые бытующие мифы о коронавирусе.

Во-вторых - перевод статьи от 10.03.2020 американского аналитика, выпускника Стенфорда Tomas Pueyo:

Коронавирус: почему надо действовать прямо сейчас (Оригинал здесь). Статья за 72 часа получила около 27 миллионов просмотров.

Приглашаю обсудить актуальные вопросы: что происходит на свете и как нам всем и каждому по отдельности нужно действовать. В первую очередь интересно мнение специалистов.

Не надо забывать, что мир уцелел, потому, что смеялся, и поэтому уместны и такие мнения:

Что происходит на свете? - Да просто чума.
 - Просто чума? Вы уверены? - Да, я уверен.
-Я уже слышал и слух этот мною проверен -
  мы и Европа уверенно сходим с ума.
-Что же из этого следует?
-Следует пить! 
Водку, коньяк, самогон и крепленые вина.
 Делать коктейли из виски, портвейна и джина.
-Надо, покуда не поздно, за этим сходить...

134 комментарии

1 / 0
В другой редакции, да пусть меня простит безвестный автор
— Что происходит на свете? — А просто чума.
  — Просто чума, полагаете? — Нет, не простая,
  Жуткими слухами нас наполняя...
  В общем, над миром тихонько сгущается тьма.
  — Что же за всем этим будет? — А будет хана.
  — Всем нам хана, вы считаете? — Да, я считаю.
  Я Апокалипсис вот уж полгода читаю.
  Ждите, прибудет Антихрист, сиречь сатана.
  — Чем же все это окончится? — Армагеддон.
  — Армагеддон, вы уверены? — Да, я уверен.
  Я уже слышал, и слух этот мною проверен,
  Сбросят на нас приблизительно сто мегатонн.
  — Что же из этого следует? — Следует пить,
  Водку, вино, и развеять всё то, что тревожит.
  — Вы полагаете, это нам как-то поможет?
  — Я полагаю,что все это следует пить.
  — Следует пить, ибо сколько бы нам не кружить-
  Нам не уйти от того, что судьба нам послала.
  — Так разрешите же в честь карнавального бала
  Снять медицинскую маску и водки налить.
  — Вирус, наверно, давно у нас где-то внутри,
  прочь медицинские маски — по кругу, по кругу!
  — Вальс начинается. Дайте ж, сударыня, руку,
  и — раз-два-три,
  раз-два-три,
  раз-два-три,

 

3 / 0
О коронавирусе: пост из Китая

Коллеги, полезно прочесть, нижеследующее, чтобы понять, как обстоят сейчас дела в Китае. Ниже человек, живущий сейчас в  Гуанчжоу, сообщает,  какие меры приняты в Гуанчжоу для борьбы с коронавирусом. Он считает, что находиться в Китае сейчас безопаснее, чем где-либо еще, где меньше порядка и организации. И не будем забывать, что спасение утопающих - дело рук самих утопающих.

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 

Напишу про наглядно видимые меры, которые принимают в городах, где коронавирус не привел к коллапсу больниц. Например Гуанчжоу (примерно 20 миллионов населения, примерно 300 _выявленых_ больных):

- "Из каждого утюга" настоятельно увещевают как можно меньше выходить на улицу, встречаться с людьми, подходить ближе 2х метров, трогать что-либо вне дома и тем более грязными руками потом в лицо, как можно чаще мыть руки и пользоваться дезинфектантами, где негде мыть.

- При явных признаках болезни (температура, сухой кашель) настаивают позвонить по спец номерам или обратится к местным властям.

- Распространяют листовки под каждую дверь (букв). На каждом экране (ТВ, уличные экраны, домофоны, интернет порталы, объявления в метро и вообще "везде") разъясняют эти правила поведения.

- Всем кто контактирует с людьми раздали бесконтактные термометры. Температуру проверяют ВСЕ охранники, ВСЕ водители автобусов, при входе в метро, в магазины, на рынки, в аптеки.

- Закрыли ВСЕ что было возможно. В первую очередь школы, сады, вузы, любые собрания, любые развлечения, магазины товаров длительного пользования (типа Икеи), большинство ресторанов (кроме, иногда сетевых типа макдональдса, где посуда одноразовая и вообще порядка всегда было больше).

- Закрыли ВСЕ проходы куда-либо, где не могут контролировать температуру или "что за люди". Закрыли двери, поставили временные заборы, повесели ленточки. В общем в Китае и так полно стен и контроля но сейчас реально "мышь не проскочит". Там где проходы оставлены оборудованы посты (палатки, охрана, термометры, дезинфектанты, иногда охрана в полном защитном снаряжении).

- В жилые зоны пускают только "своих", если кто приезжает из других городов их берут на учет, либо, как в Пекине они должны 14 дней быть в само-карантине на дому.

- Водителей и пассажиров машин (не зависимо от "понтовоссти") проверяют тоже.

- Во всех жилых зонах работают магазины, рынки, аптеки. Снабжение превосходное. Разве что масок нет. Дезинфектанты пропали, но быстро подсуетились и сейчас опять появились - глицерин со спиртом и другие для рук разливают в любую подходящую тару и наполнили магазины. Нет особой необходимости выходить за пределы локальной жилой зоны.

- Все такие магазины и рынки дезинфецируют каждый день. Иногда дезинфицируют профилактически улицы, и проходы (опрыскивают). То же кнопки лифтов, ручки дверей итп. Открыты окна в подъездах (где были закрыты).

- В автобусах открыты все окна. В автобус не войдешь без контроля температуры водителем.

- В метро тоже не войдешь без контроля.

- Пассажиров мало но транспорт ходит, чтобы не создавать толпы. Пустые автобусы не проблема, благо в развитых районах Китая они еще и электрические.

- В поездах, междугородих басах билеты продают на каждый второй ряд (программа модифицирована). Постоянно все дезинфицируют.

- Многие такси прекратили работу.

- Поощряют использование личного транспорта, открыты платные дороги и сняты ограничения на въезд в центр, если трафик позволяет.

- Открыты платные кабельные каналы.

- Организовано онлайн обучение на дому в школах

- Организованы онлайн больницы, консультация по видео с проф. врачами.

- Организованы службы психологической помощи онлайн, телефон.

- Ограничено хождение кеша. В общем там и ограничивать почти нечего было - "все" и так платили везде с телефона, без контактно.

- В административных зданиях поставили на вход тепловизоры. Вообще ставят тепловизоры "везде" по наличию. Раньше были только на границе.

- В некоторых городах запретили продавать противосимптомные средства от кашля и температуры в аптеках.

- Закрыли места проживания для курьеров, такси. Все это сейчас не до двери либо постоматов, как раньше, а до ворот.

- Если в том или ином месте проживания выявлен больной ВСЕ это место (кондоминиум, общежитие, "деревня") закрывают на карантин, выставляют посты (полиция, медики). Публикуют в офиц новостях. Вход-выход по спец пропускам и при крайней необходимости. Проводят глубокую дезинфекцию публичных мест - магазины итп. И другие местные меры.

 

- Проводят онлайн-телефон опрос всех студентов, работников, если нет возможности проверить лично все ли ок. В общежитиях проверяют температуру итп.

Выделили спец больницы, подозрительных пациентов не везут в обычные. Закрыты (точнее даже заклеены) входы в метро возле таких больниц.

- Карантинных приезжих из опасных районов помещают в выделенные гостиницы с постоянным контролем.

- Разрешают открывать производство, но там еще более длинный список гигиенических мер. Начиная от категорического запрета выходить на работу не здоровым и "далее везде".

- Контроль и ИТ-ИИ анализ больших данных о потоках людей и инфекции.

- Контроль онлайн чатов на предмет паники и слухов. Публикция детальной информации и ее распространение.

- Рекомендация снизить арендную плату для жильцов (действительно многие снизили!) и другие "послабления" т.к. "форс мажор".

итд

 

Это все исключительно местные меры, не считаю экономической гос поддержки, медзаводов итд итп в масштабах страны. Ну и в Ухане меры еще строже.

Да, если подтвержлен короновирус лечение в Китае _бесплатное_!”

 

0 / 0
Коронавирус

У нас в Москве такое трудно себе даже представить! Возможно, что нас пока "жареный петух не клюнул" и такие меры избыточны, а вероятнее такая четкая организация защиты от эпидемий нашим "успешным менеджерам" просто не по силам и не по уму... Привыкли отчитываться об "исполнении" филькиными грамотами.

0 / 0
как мне это знакомо..

с чего начиналось подыхание 99% индейки от не описанного толком до сих пор флавивируса..? Сначала оно дехло чуть больше норматива, потом выдох птичник на 20% потом на 60% а потом за три дня вымерло 99% с копейками. Позвали меня. Было интересно, да.  Или вот некий очень крупный свинарник - гора трупов высотой более 3 метров (кранбалкой поднимали наверх для компактности) в течение пары лет смертность устойчиво держалась на уровне 40-60% т.е. общая смертность а заболеваемость была более 80%. На первый взгляд очень все хорошо в плане биозащиты (несопоставимо лучше в сравнении с поселениями людей и больницами). Но это все очень крупные хозяйства т.е. многие сотни тысяч голов сконцентрированные в одном месте. Обычно очередной вирус растаскивается за считанные месяцы несмотря на реально хорошие меры по биозащите (люди моются. корма стерилизуют, вакцинации поголовные и т.д.) . Более того, в РФ требования по обеспечению биобезопасности строже чем в ЕС, у нас чище на предприятиях, более современное оборудование, хорошо оснащенные лаборатории, врачи которые много учатся в РФ и за рубежом. Помощь Ервопейской науке и хорошая интегрированность с международной практикой и т.д.  Вроде бы и не должны были заражатся..

1. С поиском новых инфекций у нас большие проблемы,  нет никакой экономической, политической и психологической мотивации искать чтото новое. Это так и в медицине и в ветеринарии. за это вообще-то наказывают. 

2. можно залить деньгами город или свинарник но это не поможет если ты не знаешь что нужно делать потому что проблема новая.. Единственное что дает сейчас карантин и прочие противоэпидемические мероприятия при CoVID19 это дать время нам, ученым чтобы мы разобрались и помогли. В РФ так тоже непринято делать. Должны ли ученые РФ и в частности ОНР прилагать усилия?  

3. есть примеры когда только и исключительно помощь ученых позволяла направить все эти миллионы инвестиций и усилия тысяч специалистов в нужное русло и проблему решить. В ветеринарии у нас это так а у них это очень часто так (там ученые создают аутогенные вакцины быстро и из местных штаммов, ищут новые инфекции и это важнейшие элементы инфекционной безопасности хот в ветеринарии хоть в медицине).

4. предлагаю обсудить. Один межвидовой переход  CoVID 19. уже был -панголин? и рукокрылые, теперь человек.. кто сказал что нету других видов и особенно близких к человеку? Появление природного резервуара чревато проблемами на долгие годы. Попадание вируса в организм, скажем,свиней или индеек, чревато очень быстрым распространением заразы по всей стране (с менее взрывным возникновением вспышек, скорее равномерно размазанный по стране рост спорадической заболеваемости, может с учетом приоритетности потребления. Если заражена индейка - то Москва пострадает больше, а если свинина то Чечня пострадает меньше, например). Помимо возможного сходства структуры ACEII у разных видов животных есть еще вопрос возможности формирования гибридных вирусных частиц (фенотипическое смешение). Когда РНК одного вируса упаковывается в капсиды другого вируса, с формированием вирусных пулов обеспечивающих размножение в клетках обоих видов. Свиньи, куры телята, индейка все имеют свои коронавирусы, в основном в кишечнике. Попадание человеческого CoVID 19  в условиях высокой концентрации коронавируса в кишечнике, например, индейки, гарантирует попадание в одну и ту же клетку двух вирусов одновременно... Для устойчивого перезаражения нужна существенно более высокая доза заражения т.к. минимальная инфекционная единица это две вирусных частицы с разными РНК (при неравной представленности этих типов у заболевшего.. а это неизбежно т.к. количество гибридных вирусных частиц это производная от количества копий РНК в организме "правильного вируса"). То есть доза заражения должна быть минимум в 10-100 раз выше. С.х. производство, особенно в РФ, Китае и США такие условия создает. Может знакомым математикам за рубежом эту мысль? 

 

1 / 0
Профессиональная оценка доступных в РФ тест-систем

PCR.news - русскоязычный информационно-аналитический портал о молекулярной диагностике и смежных областях науки и практики: молекулярной биологии и медицине.

https://pcr.news/stati/test-na-koronavirus-dlya-rossii/

От себя добавлю, что видимо в плане диагностики у нас всё весьма кисло и реальных носителей куда больше, чем заявлено официально.

 

4 / 0
Я бы не был так пессиместичен

Тест  системы   первые  есть.  Да,  не  идеальные.   Но     работающие.  Наличие   ложноположительных  в  условиях   эпидемии  скорее   плюс   -  нет  пропуска  потенциальных  пациентов. Чувствительность  - да,  лучше   побольше.  Но  опять  же  10  в  пятой   -  это   вполне  себе  неплохо.   Терки  между   производителями   были,  есть  и  будут .    Опять  же  рынок  -  новый  и  большой  -  с  заранее   ограниченным   второй   группой  патогенности   доступом. 

Но     при  этом  тоже  уверен,  что  идет  недодиагностика   -   за  счет   бессимптомных носителей   .  Но   для  их  выявления  нужно  массовое  тестирование  по  типу   Южной  Кореи  -  которого  нет.  Оценка   этого  числа  крайне  важна   для   определения  уровня   смертности  и  общей   критичности  ситуации с  COVID

2 / 0
Если у нас тестов мало, надо купить их там, где есть.

Дело не в оптимизме или пессимизме, а в организации. Если у нас тестов мало, надо купить их там, где они есть. И независимо от терок производителей сейчас надо дать денег всем. Ведь это критично для здоровья нашего. Об этом кричать надо на всех углах, через все СМИ. Иначе не пошевелятся.

3 / 0
Но везде с этим плохо

Ну  как  нельзя   родить  за  месяц  -  так  и  нельзя  сделать  сразу  идеальную  тест-систему. Причем   на  новый   вирус.  И  производства  раскачанного  на    сотни  тысяч    тест  систем  на   экспорт пока  нет  нигде. 

 

0 / 0
Большое спасибо, Петр Андреевич.

Ваше мнение как эксперта просто бесценно.

А что там был за шум по поводу связи АПФ и коронавируса?  

И ещё пугали ибупрофеном в качестве назначения при COVID-19 ...

Если сможете, держите нас, пожалуйста, в курсе дела по самым важным научным находкам по этой теме, хотя столь быстро достоверных результатов ожидать, наверное, не приходится...

2 / 0
У меня ссылки нет под рукой,

поищите  в   ютюбе     лекцию  Анчи  Барановой.  Там  все    весьма  подробно   -    от   биологии   вируса,  роли  АСЕ2   белка в  развитии  дисфункции  альвеолярного  эпителия,  до арбидола  и  других   лекарств  при  COVID.

Пока  писал  -  нашел

  https://www.youtube.com/watch?v=O9BZWrNjJ3E&t=1393s

1 / 0
Большое спасибо, все смотрим.
0 / 0
По словам вице-премьера, в России нет дефицита тест-систем

Петр Андреевич, прокомментируйте, пожалуйста, слова Голиковой:

В России уже зарегистрированы три тест-системы для диагностики коронавируса и идет разработка четвертой. Об этом сообщила вице-премьер Татьяна Голикова, передает «РИА Новости».

Голикова уточнила, что речь идет о двух тест-системах государственного научного центра «Вектор» и одной тест-системе Министерства здравоохранения. «Сейчас еще в работе находится одна тест-система, которая, может быть, на этой неделе будет зарегистрирована», — отметила она.

По словам вице-премьера, в России нет дефицита тест-систем и Роспотребнадзор готов обеспечить ими все российские регионы. 

Подробнее на РБК:
https://www.rbc.ru/rbcfreenews/5e6f9d449a79479c429ca91b

1 / 0
Она же где-то сказала, что сейчас в стране в день

выпускается  100000 (100   тысяч)    тест  систем  и  всего  выпущено   700  тысяч.  Что   не  очень  стыкуется.

По   поводу   тест-систем  -    я  видел   СР  на   2  тест  системы,  одна  от  Вектора  и  вторая   от  Шипулина  (это  то,  что  названо   Минздравовской).  У  нее   регистрация  мартовская. 

О  возможности  мссового  тестирования.    Две  проблемы   -    техника   (машинки   для   ПЦР,   системы   для  выделения   РНК  и  автоматы  для  раскапывания    ПЦР  реакций)  и  люди.    Я  с  трудом  могу  оценить  оба  компонента.   В   большинстве  случаев  у  нас  стоят   96-луночные     амплификаторы,  на    цикл  от  выделения   РНК   до  результата  минимум   5-6  часов.  Итого  в  день  2  постановки,  200  образцов.  Много  хуже  с  автоматами   для  выделения  и    раскапывания -  и  все      упирается  в  подготовленный  персонал  для   выделения  РНК  и  постановки   ПЦР. 

ЗЫ.  Я  14   утром  прилетел  из  Испании.  Сижу   дома,  сегодня    у  меня  и  жены    взяли  мазки  из  носа  и  глотки.  К  моему   удивлению  -   ватные      палочки,  не  щеточки  (на  них  намного  больше  ткани  берется).  Куда  повезут   -   дамы  из  поликлиники  не   знают.  Когда  результат  -  тоже.  В  квартиру   вошли  одетые  с  ног   до  головы   -  костюм,  маска,  очки.  Но    влезали в  одеяние  на   лестничной  клетке. 

0 / 0
на массовое тестирование структуры роспотребнадзора и не могут..

быть рассчитаны. Если речь идет о нескольких лабораториях (новосибирск, москва и т.д.) это ведь ограниченное количество амплификаторов. Даже если это 384 луночный прибор будет иметь место лимитирование по выделению большого количества проб и персоналу. С персоналом кстати тоже проблема ибо текучка, во многих государственных лабораториях мягко говоря велика. Если переместить в регионы то это автоматически добавит по 1 прибору на регион минимум т.е. + 200-300 проб в день. Если не ограничивать дело лабораториями потребнадзора то есть обл ветлаборатории, коммерческие лаборатории, научные институты. Это утроило бы количество тестов в день. Крупные медицинские центры имеющие ПЦР лаборатории в сумме обладают еще большими мощностями. 

Не тестировать дополнительно уже пришедших пациентов - неразумно. Запрещать тестировать здоровых людей тоже очень странно. Кстати и тестирование носоглотки тоже выглядит не очень. Процент людей с насморком среди заболевших невелик, около 4%.  Есть мнение что в кишечнике носительство бывает чаще т.е. надо бы параллельно проверять наличие в стуле.. Кстати за рубежом есть соответствующий протокол.

3 / 0
тест на вирус - как тест всей системы

К сожалению, ситуация с коронавирусом выявила кучу проблем, среди которых изготовление тестов – не самая большая. Тест-наборов, вроде как только у нас в стране производятся и тестируются 4 варианта. В Минздраве заявляли про производство 150 тыс. тестов в день. Наши чиновники хотят «догнать и перегнать Запад» и как ориентир, видимо, взяли Германию с их объёмами тестирования. Благое намерение, но даже если в России оперативно наладят огромное производство этих наборов – дальше-то что? Недавно слушал радио, сообщают что в Екатеринбурге в день обрабатывают «порядка 700 тестов» – это примерно 8 плашек. Предположим, что на одной ПЦРнице работает 1 лаборант и всё раскапывает вручную одноканальной пипеткой. Выходит, на весь Екатеринбург имеется максимум 4 лаборатории (ну не верю я что можно за день меньше 2 плашек прогнать). И это – в мегаполисе! Цифра похожа на правду, т.к. в столице власти планируют «дополнительно запустить 4 лаборатории для диагностики коронавируса». Выходит, в обычных провинциальных обл.центрах есть в лучшем случае 1-2 лаборатории, способных прогонять по паре плашек в день. Будем оптимистами и предположим, что на Россию наберётся пара сотен таких лаб – выходит, что максимум сколько в стране можно провести – примерно 40 тыс. тестов. Куда девать ещё порядка сотни тысяч наборов? Таких объёмов невозможно освоить не только физически, но и, образно говоря – и физиологически. Конечно, можно выделить помещения, закупить оборудование и, о ужас эффективных манагеров - нанять ещё лаборантов – но это долгая история, с лицензированием и сертифицированием. Хорошо, даже если решить всё и делать по 100 тыс. тестов в день – то возникает другая сложность. А именно: после «оптимизации» системы здравоохранения у нас фактически загублена система шаговой доступности медицинских услуг. Например, я когда приехал на работу в наш Институт – в районе было 3 больницы, теперь осталась 1 (!). И это довольно богатая Ярославская область, всего-то 300 км. от Первопрестольной! На моей родине, в Костромской области, после создания окружной больницы к ней прикреплён контингент аж ещё двух районов! Вот и прикиньте – у нас сейчас на район работают только 5 бригад скорой помощи. Сколько у них займёт сил и времени забрать ещё и образцы на коронавирус от, скажем, тысячи человек? Потом их надо как-то транспортировать в обл.центр – как? Гонять УАЗик-«неотложку» хотя бы через день за 200 км? Так у нас "скорых" не останется вовсе уже через месяц – просто рассыплются вместе с водителем и фельдшером. Далее – выявили коронавирус, что делать с больным? Аппаратов ИВЛ только 2 штуки на больницу, а после «оптимизации» единственная наша рай.больница и так переполнена (конечно, никаких индивидуальных боксов нет и сделать их невозможно). И такая же ситуация – по всей стране, уж по провинции-то я поездил достаточно. Да, есть «путинская» больница в Коммунарке – но это же просто «потёмкинская деревня» на фоне всей остальной страны! Так что проблема вырисовывается комплексная, связана с организацией всей системы здравоохранения, и начинать надо с первичной. Это требует долгой и кропотливой работы, гораздо сложнее чем наладить выпуск тестов.

 

0 / 0
наборы просто не довезут

это же холодовая цепь нужна. Взял пробирку с ферментом в глицерине в руку, погрел теплом тела и нету фермента.. Днк полимераза еще худо бедно держит, с РНК полимеразой все сложно. Даже мы в Новосибирске стараемся работать с местными ферментами т.к. очень часто просто не довозят, даже из Москвы.. массовое тестирование населения по стране в целом уже не нужна. Вот в благополучных регионах можно было бы наладить такую работу, подогнать мобильные пцр лаборатории, перебросить персонал и изолировать эти регионы от притока инфицированных людей, отслеживать инфицированных и контактных с ними людей т.е. делать в микромасштабе на уровне регионов, отдельных населенных пунктов то, что сделали сингапур, южная корея и китай. География нашей страны позволяет добится успеха. Уровень развития пцр диагностики у нас не плох, мы даже скорее опережаем среднемировой уровень и надо этим пользоватся. 

Надо забить болт на сертификацию - акредитацию, вернуть право на работу со второй группой тем лабораториям у которых это право забрали (2019 год как раз роспотребнадзор зачищал всякие инфекционные лаборатории, институты, сокращал персонал и т.д.). Важно ведь не гипердиагностика а избежать недовыявления носителей. Лучше проводить плохую пцр диагностику чем никакую..Например, наш ветеринарный НИИ может делать 600 тестов в день.  Я не думаю что мой 20 летний опыт в этой области так уж плох. Пробы должны брать все кто работает непосредственно с людьми и сам может заразится а не ездить всякие дяди пытаясь объять необъятное. Может пусть люди сами берут пробы, пакуют в пакеты и выкладывают в какой-нибудь контейнер на улице. 

Можно создавать локальные зоны с минимальным риском заражения для пожилых людей, групп риска, достойных людей (во всяких санаториях и деревнях). Затем ПЦР исследования важны для оценке эффективности мероприятий, схем лечения, препаратов. Собственно это самое важное сейчас. Все усилия по задержке распространения инфекции, повторюсь, нужны чтобы понять как лечить и снизить смертность. То что РФ не самая первая страна по уровню заражений уже дает нам хороший шанс т.к. накопился опыт лечения.

 

0 / 0
Как из салфетки сделать маску

В аптеках Питера масок нет уже две недели. Но, оказывается, маску легко сделать самому из салфетки и резинки!

инструкция имеется здесь.

2-й рецепт - из марли - имеется здесь.

3-й рецепт ищите здесь

Но самый простой и изящный, по-моему, размещен у нас на сайте в разделе "В помощь научному работнику"  PPTX файл надо скачать и открыть на полный экран.

0 / 0
но и это еще не все.. что нужно делать

п.1 ВСЕ известные мне коронавирусы ОБЯЗАТЕЛЬНО есть в кишечнике. Более того, обычно коронавирусы вторично попадают в легкие гематогенным путем из кишечника (300 м2 площадь слизистой + возможности для процесирования вирионов, обеспечивющие их инфекционность). Поэтому тестирование носоглотки не вглядит эффективным способом диагностики. НУЖНО тестировать соскоб из прямой кишки, можно провести тампоном по поверхности свежих фекалий, слегка подсушить и отправить в пакетике на анализ.

п2. ВАЖНО массовое ПЦР тестирование клинически здоровых людей т.к. они могут наиболее опасными носителями. Как следует из п.1 орально-фекальный путь заражения может быть важнее воздушно-капельного. Дарейного синдрома чаще не будет т.к. вирусы обычно в тонком отделе кишечника и признаков воспаления там сложно увидеть. Вывод - клинически здоровых людей должны тестировать ВСЕ ПЦР лаборатории. Каждая проба РНК выделенная Инвитро от их клиентов-пациентов и прочими лабораториями должны проверятся на коронавирус (в стоимости анализа стоимость выделения это половина затрат по деньгам и больше половины по трудозатратам).

п.3 В РФ помимо огромного количества ПЦР лабораторий очень немало специалистов которые могут собрать ПЦР тест взяв структуры праймеров из научных публикаций и руководствуясь рекомпедациями ВОЗ. Положительные образцы можно валидировать секвенированием или передав в соответствующую структуру Роспотребнадзора. Объем тестирования клинически здоровых людей можно было бы довести до многих тысяч тестов в сутки в каждой области нашей страны. Массовое ПЦР тестирование дает результаты в Сингапуре, Южной Корее, Японии. Роспотребнадзор должен бы возглавить этот процесс а МЧС или ФСБ должны бы проконтролировать случаи саботирования этой деятельности.

п.4. все это актуально на начальном этапе эпидемии, потом эффективность процесса будет слишком велика, чтобы изоляция что-то давала. Возникают вопросы фармакопрофилактики и терапии, патогенеза, разработки вакцины. К сожалению научных проблем много и их нужно решать сейчас. Как вариант  рекомендую воспользоваться опытом ветеринаров (как это имеет место в Израиле). Напоминаю, что коронавирусы животных известны давно и опыт работы с ними у ветеринаров огромен. Поэтому у нас точнее прогнозы и вызывает удивление деятельность медиков на начальных этапах. Видимо следует актуализировать тестирование эффективности методов терапии коронавирусных инфекций животных  т.к. это наиболее надежная модель общепризнанная в большинстве развитых стран, кроме РФ. Также напоминаю что это был межвидовой переход с животных на человека и вероятность распространения через каких-либо животных остается (у собаки уже нашли). Помощь математиков также нужна ну или людей которые помогу связаться с математиками за рубежом и помочь с переводом на английский. 

п5. экспериментальных тестов разработано много и ПЦР и LAMP. в качестве ВКО можно тестировать РНК человека (гены домашнего хозяйства), положительный контроль можно сделать синтетическим.

п.6 я тут уже поднимал вопрос о необходимости вовлечения ученых ОНР т.к. это теперь наша общая проблема. Межведомственное взаимодействие в РФ всегда было не на высоте и если из-за этого смертность в РФ будет выше, то это будет справедливо и, надеюсь, простимулирует к решению этой проблемы.

п.7 как бы довести это видение, если оно, конечно, заслуживает внимания до.... до кого?

0 / 0
п. 1

Читайте    про COVID  и  не  пишите   очень  странных  сообщений. 

И  напоминаю  -   это I-II   группа  патогенности.  С   соответсвующими  требованиями к   лабораториям.  Таких   лицензированных   лабораторий  мало.  И  пока  вопрос  о  возможности  работать в  условиях III-IV  групп  только  рассматривается. 

0 / 0
"Инвитро" начнет проводить анализы на наличие коронавируса?
0 / 0
Конечно да.

При  этом  они  будут  работать  не  на  Векторе  -  а  на    ките  от  Германа  Шипулина.  Вторая   допущенная в  РФ  тест  система.  И   в  основном с  населением,  не  имеющем  никакой    клиники COVID. 

0 / 0
замечательно

это право гражданина защищатся от инфекций и иметь возможность не заразить своих близких.

важно привлекать все возможные ресурсы максимально безопасным образом. 

видимо следует создать конкурентность рынка..

еще есть вопрос межвидового перехода на другие виды животных, следовательно нужно привлекать и ветеринарные лаборатории или даже нужно их привлекать и для тестирования образцов предоставленных медицинскими учреждениями или задействовать в (выделении РНК, ревертировании) ведь там и II была пока роспотребнадзор не начал ликвидировать эту возможность в немедицинских учреждениях. 

кризисы для того и нужны чтобы приложить усилия для ликвидации неэффективностей нашей системы биобезопасности. Хотелось бы напомнить что если бы коронавирус возник у нас, то пришлось бы ждать его утечки за рубеж и выявления где-нибудь в Ухане.. РФФИ грантов на поиск и изучение новых инфекций не дает а роспотребнадзор за такое уволит.

 

0 / 0
есть разница между тестированием клинически больных

и клинически здоровых. С точки зрения ограничения рисков распространения возбудителя второе неимоверно важнее. Юридически это точно такие же люди которые приходят, в инвитро, например, для решения самых разных, неинфекционных в т.ч. проблем со здоровьем. 

На худой конец имеет смысл тестировать на Covid 19 все образцы биоматериала попавшие в любую пцр лабораторию. Как принципально это повысит риски инфицирования персонала если состав пациентов не изменится?

Хотелось бы напомнить что проблема транспортировки наборов содержащих ревертазу решена не во всех регионах нашей стране. Несоблюдение холодовой цепи ведет к инактивации ферментов, как минимум. Транспортировка проб биоматериала в лаборатории, где разрешено тестирование, несет риски заражения граждан в процессе централизованной доставки проб и это крупные города типа москвы и новосибирска.. Попытка провоза РНК несет риски распада РНК и т.д. Есть возможность заниматься диагностикой в регионах  надо ее реализовывать. Например в Сибири можно на месте приобрести нужные ферменты и это лучше чем везти их из Москвы и наоборот. 

Промедление в организации диагностики преступно. За попытки погреть руки на ведомственной разобщенности стоило бы наказывать. Каждый день промедления может потом стоить многих жизней. 

Наш опыт показывает что вакцинопрофилактика в стационарно-неблагополучных населенных пунктах при коронавирусных инфекциях это далеко не то же самое что вакцинопрофилактика гриппа и оспы. Иммунитет скорее будет нестерильным и привитые люди могут стать бессимптомными носителями. Предотвращение распространения заразы намного дешевле и эффективнее. 

0 / 0
Возможно ли самозаражение?

Василий Николаевич! Поясните, пожалуйста, эту фразу: 

ВСЕ известные мне коронавирусы ОБЯЗАТЕЛЬНО есть в кишечнике. 

Значит ли это, что каждый может заразиться сам от себя? Или Вы имеете в виду, что если человек подхватил вирус у кого-то, то вирус легче всего обнаружить в фекалиях?

0 / 0
Ищут вирус в нечистотах

Это сообщение из Nature имеет отношение к коронавирусам в кишечнике

http://onr-russia.ru/comment/19284#comment-19284

More than a dozen research groups worldwide have started analysing wastewater for the new coronavirus as a way to estimate the total number of infections in a community, given that most people will not be tested. The method could also be used to detect the coronavirus if it returns to communities, say scientists. So far, researchers have found traces of the virus in the Netherlands, the United States and Sweden.

0 / 0
Да!

Мне конечно, как ученому. приятно, что три месяца назад я оказался прав и сейчас это заметили уже и медики. Но! Три месяца назад мы могли начать более углубленную работу в этом направлении.. делано слишком мало.

В этом и проблема. Например, по оценкам некоторых экспертов 20 млн. итальянцев заражены. То есть они заразились, засели в домах и далее получили манифестацию инфекционного процесса за счет генерализации из кишечника. Вирус низкокопийный, по разным оценкам это порядка 100 тыс. копий на 1 мл. биологических жидкостях в назофарингеальном мазке. Встречаемость в фекалиях выше и первые случаи которые у нас выявили были именно из проб из прямой кишки. Прошу заметить, несмотря на то что вирус размножается в тонком отделе кишечника а в толстом отделе разрушается микрофлорой и т.д. + в кале много ингибиторов и РНКаз. Сейчас мы лихорадочно пытаемся повысить эффективность изоляции вирусной РНК ибо чувствительность ПЦР тестирования слишком уж низка. 

Отсюда вытекают следующие моменты 

какие задачи нужно решить чтобы снизить повреждения тканей на ранних этапах при коронавирусной инфекции (у котиков инфекционный перитонит, ОРДС, фиброзную пневмонию COVID19 у людей соответственно )?
1. Снизить вирусную нагрузку в кишечнике (полагаю, вклад вируса из кишечника может быть достаточен для последующего повреждения легочной ткани даже без интенсивного размножения вируса в самих легких). Очевидно пригодны препараты с прямым вироцидным действием (мишени РНК, оболочка, дисульфидные мостики поверхностных белков суперкапсида и т.д.). На этапе инфекции
2. Содействовать переключению иммунного ответа Th1/Th2 в сторону гуморрального иммунитета на начальных этапах инфекции или в период риска заражения (иммуномодуляторы, споровые пробиотики?)
3. Индукция синтеза бетта-интерферона на ранних этапах
4. торможение миграции иммунокомпетентных клеток в очаг воспаления в легких (ингибитор металлобетталактамазы, макролиды) чем меньше таких клеток тем меньше повреждений легочной ткани и, следовательно, меньше фиброза
5. Снижение интенсивности воспаления, для поддержания функционирования легких и профилактики фиброза
6. Подавление роста соединительной ткани после 5-10 дней вирусной пневмонии

В чем смысл? - Вполне возможно, что если бы умершие от COVID 19 и, что самое главное, на начальной фазе инфекции получали бы фармакопрофилактику фиброза легких, разрушения Т-киллерами пневматоцитов, то возможно они и не оказались в столь тяжелом состоянии... Важнее даже не минимизации риска смерти, который и так не велик. Важнее профилактика тяжелых, хронических поражений легких, которые могут существенно снизить функциональность легких в долгосрочной перспективе. Таких людей может быть больше. 

 

https://vk.com/club192369641

 

похоже что наша медицина просто не вытянет большого количества тяжелых больных.. или мы пытаемся успеть разобраться в фармакопрофилактике или продолжим тормозить и далее...  Если резкий всплеск вирусных ОРВИ в феврале не был коронавирусом, то эти переболевшие могут пострадать существенно сильнее, так как активация Т клеточного иммунитета будет усиливать повреждения легких

ну и советую воздержатся от потребления индейки и свинины.. есть сомнения но роспотребнадзор сам не тестирует и разрешений ветеринарам легально оценивать эти риски не давал.. Просьба может переслать рекомендацию срочно протестировать индейку в другие страны. У нас такая возможность сейчас ограничена, считайте это интуицией...Вдруг я и тут не ошибаюсь.. 

1 / 0
Выпуск журнала "Природа"
"Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты"
1 / 0
коронавирус был искусственно создан в 2015 году в США?
1 / 0
А вот и современное продолжение, написанное популярным языком:
0 / 0
Да нет, его Бог послал.
 
Л.Каганов может возмущаться и морализировать сколько угодно - это ничего не изменит. Действительно, мы живем в хрупком мире и то, что мы еще живем - это уже чудо. И никакая пандемия не прекратит научные исследования. А если кто-то в мире занимается биологическим оружием, то кто-то должен заниматься и защитой от него. И это даже хорошо, если те и другие будут публиковаться в одних и тех же журналах. А от ошибок никто не застрахован, хотя, конечно, за них нужно наказывать.
 
Перечитайте еще "Далекую радугу" Стругацких. Это посильнее Каганова будет.
0 / 0
То есть внеземное происхождение?
0 / 0
Бог - он Вам не метеорит!

Неважно, произошел этот коронавирус от метеорита, чистых рук любопытных ученых или грязных рук создателей биооружия. Все это - проявление промысла Божьего. В это надо верить. А если не верите - нарушаете новый Основной закон Российской Федерации, который уже работает, поскольку принят двумя третями региональных парламентов. В нем написано, что предки передали нам веру в Бога. Значит, так оно и есть, даже если кто-то за это не проголосует. Не надо даже сомневаться в том, что сказал Патриарх. Изучайте свои гены-шмены, а небесных сфер не касайтесь!

0 / 0
Ну, что Вы...

Александр Львович, как Вы могли помыслить, что рядовой член ОНР нарушает Основоной Закон Российской Федерации? - Метеорит-то, Бог послал с кокретной целью, которая нам неведома. Но Патриарх растолковал целеполагание, так что теперь все стало ясно.

0 / 0
Кстати, пока основной закон с поправками не работает

http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_28399/

 

по-моему, если вчитаться, то не работает

 

надо идти на голосование, забавно названное "одобрением"

1 / 0
Статья в Nature

Срасибо, Сергей Вениаминович, за ссылку на Каганова, а Каганову - за статью в Nature. Ссылки были бы более полезны, если бы сопровождались цитатами. Цитирую Каганова.

В 2015 году на главном научном сайте планеты появилась сухая публикация... В 2014 году группа ученых университета Северной Каролины начала исследование: взяли неопасный для человека коронавирус китайской летучей мыши SHC014 (его поверхностный белок) и перенесли в известный уже на тот момент человеческий вирус SARS. В итоге через годик напряженной работы успешно синтезировали «in vitro and in vivo» новенький гибрид, годный для человеческой эпидемии. … американское правительство спешно в том же 2014 году утвердило мораторий, запрещающий эксперименты с патогенными инфекциями человека. ... работу заканчивали уже в Китае... в Институте вирусологии Китайской академии наук, в городе Ухани. … лаборатория в Ухани обладает 3-й степенью биозащиты (BSL3). Хотя для настолько опасных исследований степень защиты должны быть максимальной: 4… В итоговой статье, начатой в Северной Каролине, а законченной в Китае, мы в списке авторов можем видеть несколько китайских имен. В частности – милую даму Shi Zheng-Li. Все эти годы она не унималась: и в 2017 году, и до, и после она продолжала работать в своей не сильно защищенной лаборатории над проблемой: как передать человеку коронавирус летучей мыши? Закономерный итог этой работы: именно Shi Zheng-Li именно в городе Ухани диагностировала в декабре 2019 эпидемию нового коронавируса.

0 / 0
Приношу извинения

К сожалению, я распространил ложную информацию. Почитав статью Nature 2015 повнимательнее, я переменил точку зрения и прошу Михаила Сергеевича уточнить, прав ли я хоть теперь или опять что-то напутал. Итак, патогенный вирус SARS имеет белок, обеспечивающий его присоединение к клетке человека, а у китайского вируса SHC014, – как и у всех коронавирусов, живущих в популяции летучих мышей, – есть похожий белок, но не совсем тот, и поэтому он не опасен для человека. Однако есть основания предполагать, что этот «недостаток» может самоустраниться путём мутации, и тогда спрашивается: будет ли мутант патогеном и будут ли тогда на него действовать лекарства и вакцины, применяемые против SARS? Чтобы ответить на эти вопросы, авторы адаптировали оба вируса так, чтобы они прикреплялись к клеткам обычной (mice), а не летучей (bat) мышки. Другими словами, они синтезировали два новых вируса, патогенных для мышки, но не для человека. Оказалось,… ну и т.д. Опасность этих вирусов для человека, конечно, существует, но она не больше, чем у природных штаммов, поскольку и для синтетических вирусов мутации никто не отменял.

1 / 0
Математическая эпидемиология

Математические модели исследования динамики эпидемий - область достаточно старая. Считается, что математические методы для изучения заболеваний были впервые применены в 1760 году Даниилом Бернулли, который оценивал с их помощью эффективность различных способов прививки против оспы. Современные модели появились в 1910-х гг. в работах лауреата нобелевской премии по медицине 1908 года Рональда Росса и Андерсона МакХендрика. Простейшие модели описываются нелинейными обыкновенными дифференциальными уравнениями 2-3-4 порядка и их стохастическими аналогами. С учетом вакцинации (управления) модели становятся кибернетическими и допускают постановку различных кибернетических задач. Подробнее можно прочитать об этом в обзоре 

Zhen Wanga, Chris T. Bauch, Samit Bhattacharyya, Alberto d’Onofrio, Piero Manfredi, Matjaž Perc, Nicola Perra, Marcel Salathé, Dawei Zhao. Statistical physics of vaccination. Physics Reports, Vol. 664, 9 Dec. 2016, pp. 1-113,
быстро ставшим Highly Cited Paper и имеющимся в открытом доступе.
 
Если кто-то захочет дать своим студентам задачки для знакомства с этой увлекательной и, увы, актуальной тематикой, можно порекомендовать небольшую книжку 
где есть исторические сведения и ссылки на литературу.

В отличие от российской книги, в обзоре в Physics Reports есть ссылка на нашу работу 2009 года, где даются условия колебательности по Якубовичу решений нелинейных ОДУ.

1 / 0
спасибо

до появления CoVID 19  мы радикально изменили свое понимание кое каких респираторных коронавирусных инфекций (повезло). Соответственно прогноз о том что это CoVID 19  в основном репродуцируется в кишечнике был дан в первые же дни и таки совпал :))

Из этого вытекает необходимость пересмотреть подходы к лечению (кстати и здесь кое с чем удалось угадать).

Математическое моделирование новой модели коронавирусной инфекции было бы полезно и в аспекте эпидемиологии и в аспекте лечения. У нас математиков нет... Можно, конечно подождать когда зарубежные математики, в рамках сотрудничества с зарубежными врачами создадут новые модели или поробовать тут в РФ.

1 / 0
Модели эпидемий.

Василий Николаевич, что Вы такое говорите! Как это нет у вас математиков: есть Институт математики им. С.Л.Соболева (не говоря уже об НГУ). Очень сильный институт, у них был мегагрант - уж я-то знаю. Почему бы Вам не позвонить или написать, например, Владимиру Николаевичу Потапову, активному участнику сайта ОНР и не обсудить, кто в ИМ СО РАН мог бы заинтересоваться такой задачей в свободное (пока) время? Математики могут взять известные модели (SIR или SEIR) и на основании ваших данных модифицировать их. На самом деле модель сейчас всех интересует распределенная, и даже проще - сетевая. Каждая страна - узел сети, а коэффициенты связи узлов подстраиваются со временем на основании данных, которые по странам имеются. Конечно, точного прогноза не выйдет, но тенденции можно попробовать поймать. Я понимаю, что Ваши иммунологические модели - это другое, но с ними также можно разобраться, были бы данные. В общем, если есть два соруководителя - прикладной математик и эксперт, то задача моделирования решается. 

0 / 0
Моделей достаточное количество и есть довольно точные.

Несколько лет назад (5-7) в университете Франкфурта-на-Майне попал на семинар, на котором докладывалась работы по моделированию разноса инфекции на основе данных об авиаперелётах.  В моделировании были учтены почти все регулярные рейсы в мире. Давались примеры для конкретных аэропортов. Сейчас появились обширные статистические данные, можно извлечь необходимые параметры и коэффициенты. Есть исследователи, которые могут спрогнозировать ситуацию.

Но тут как и с нашими показателями публикационной активности - чиновники не читают научную литературу и не вникают в научные результаты. Вы можете представить, чтобы вместо неуклюжих пресс-релизов роспотребнадзора с тривиальными советами чаще мыть руки, появились серьезные тексты с прогнозами развития эпидемии, оценками потребности в медоборудовании, персонале на ближайшие две-три недели?   Я не могу это даже представить...

1 / 0
матмоделирование

Конечно в Новосибирске есть специалисты в области матмоделирования различных естественных процессов. Например, в НГУ есть лаборатория https://www.nsu.ru/n/research/divisions/mathematical-sciences/1719943/  основными направлениями исследований которой являются "создание новых математических моделей теории упругости, электродинамики, акустики, астрофизики, иммунологии, эпидемиологии, фармакокинетики, экономики и социальных процессов". А в списке основных результатов прошлых лет имеется пункт "исследована простейшая модель инфекционного заболевания, которая характеризуется параметрами иммунитета и заболевания."

0 / 0
пример с неадекватностью моделирования

вот пример статьи этой лаборатории https://www.researchgate.net/publication/318262188_Inverse_problems_of_immunology_and_epidemiology

например, получена вполне хорошая модель описывающая динамику изменения концентрации вируса иммунодефицита человека, инфицированных клеток, и т.д. Наблюдается неплохая сходимость наблюдаемых изменений с моделью. Однако, в системе дифференциальных уравнений никак не прописывается активация иммунного ответа при увеличении концентрации антигена (т.е. вируса). Может ли этот фактор не влиять на остальные элементы модели - нет.... То есть модель не должна была бы сходится.. Но она сходится т.к. подобраны различные поправочные коэффициенты и т.д. (как я понимаю). Модель лекарственной устойчивости к микобактериям также не учитывает некоторые факторы но схоимость модели и тут вполне ничего себе (а не влиять пропущенные факторы на процесс не могут).

Понятно что математики и не должны разбиратся во всех нюансах инфекционных процессов, иммунологии и т.д. эту информацию им должны дать ученые инфекционисты. С другой стороны - остутствие сходимости моделей как раз и интереснее т.к. и вынуждает искать недостающие влияющие факторы.

Ну и попытки связаться с некоторыми из авторов пока не увенчались успехом.

0 / 0
прошу прощения, что поздно обнаружил
Приглашаем вас присоединиться к онлайн-открытию конференции -
    пленарному заседанию секции Математика, которое состоится *9.04 с
    16:00 *по ссылке https://zoom.us/j/987684192. Планируются доклады

      o "Математическая модель распространения эпидемии COVID-19" г.н.с.
        ИВМиМГ СО РАН, ведущего ученого Математического центра в
        Академгородке, чл.-корр. РАН Сергея Игоревича Кабанихина;
2 / 0
МСГ "на тему злых/глупых ученых"

https://www.facebook.com/mikhail.gelfand/posts/2907921469329486

"Было велено поубедительнее высказаться на тему злых/глупых ученых. Высказываюсь. (1) Сначала была теория, что в вирусе SARS-CoV-2 (далее Вирус) есть вставки из вируса HIV. Оказалось, что авторы избирательно репортировали результаты, вставки короткие на уровне статистического шума, такие же вставки есть в других коронавирусах, а также в белках множества животных и растений. Авторы отозвали статью. (2) Потом была теория, что Вирус похож на вирус летучей мыши, который изучали в Том Самом Институте (и опубликовали последовательность - можно сравнить), потому заражение было не на рынке, а в лаборатории. Не получается - слишком много различий, чтобы объяснить их и случайной эволюцией, и направленными мутациями. (3) Потом была теория, что сбежал рекомбинантный вирус (ген S-белка вируса летучей мыши был вставлен в аттенюированный SARS, способный размножаться в клеточной линии мыши). Опять не получается - много различий. Тут в качестве дополнительной конспирации написали, что последовательности рекомбинантного вируса нет в Генбанке - так и не должно быть, в Генбанк давно не закладывают последовательности конструктов, сделанных из известных частей - потому что незачем. (4) Писали, что в Италии ходит особо злобный штамм, завезенный туда, видимо, злыми китайцами - в Италии зарегистрировано несколько штаммов, они не образуют единой клады на филогенетическом дереве, надо грешить не на штамм, а на какие-то культурно-медицинские особенности. (5) Писали, что в последовательности Вируса видны следы манипуляции (фрагмент в несколько аминокислот, похожий на аналогичный фрагмент панголина, и сайт узнавания протеазой), которые, возможно, делают его более вирулентным для человека. Утверждения про последовательность верны, про манипуляции - нет, по следующим причинам (которые я уже приводил): (а) если это манипуляции в злобных целях, никто не публиковал бы промежуточные работы - конструкция теории заговора оказывается внутренне противоречивой; (б) если это манипуляция в исследовательских целях, то ее не было, потому что ее никто не делал, потому что она никому не нужна - и, кроме того, просчитать, какие именно замены ухудшат вирус (почему панголин?), никто не умеет. Кажется, я ничего не забыл. Ах, да, была еще теория, что вирус прилетел на метеорите (действительно была), но это уже другая история. <..> Disclaimer: я не гарантирую, что буду отвечать на любой и каждый комментарий."

https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440

https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1.full.pdf

https://www.gisaid.org/epiflu-applications/next-hcov-19-app/

Та Самая Статья https://www.nature.com/articles/nm.3985

https://www.researchgate.net/publication/339351990_Decoding_evolution_an...

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17934078

 

0 / 0
Инициатива Elsevier

Announcing the author resilience center

A collection of resources to support you during a difficult time:

https://www.elsevier.com/authors/journal-authors/misc/author-resource-ce...

Спасибо, Elsevier !

 

0 / 0
Первые результаты моделирования динамики COVID-19

Jomar F. Rabajante, Insights from early mathematical models of 2019-nCoV acute respiratory disease (COVID-19) dynamics:

https://arxiv.org/abs/2002.05296

Интересный обзор нескольких моделей распространения коронавируса: 

The model shows that the exposure time is a significant factor in spreading the disease. With a basic reproduction number equal to 2, and 14-day infectious period, an infected person staying more than 9 hours in the event could infect other people. Assuming the exposure time is 18 hours, the model recommends that attendees of the social gathering should have a protection with more than 70 percent effectiveness.

Оказывается, что именно длительность общения с зараженным имеет первоочередное значение. То есть видимо то, что мимо вас на улице прошел носитель короновируса не имеет значения, вирус не перепрыгнет за минуту, а вот 1-2 рабочих дня в одном помещении с носителем будут очень опасными. Вспомним "Diamond Рrincess". Это также означает, что мытье улиц, вагонов метро, закрытие магазинов, транспорта - занятие бессмысленное, а вот тшательное отслеживание и изоляция (самоизоляция) длительно контактировавших с носителем - великое дело, как и выполнение огромного числа достоверных тестов. Таким образом, успешная тактика Южной Кореи получила свое математическое объяснение.   

1 / 0
Удивительно?

Не понимаю этого открытия: длительный контакт с носителем опасен, что тут нового? И без математики очевидно.

0 / 0
Но с другой стороны известно, что бывают суперраспространители..

то есть способность заражать других очень сильно варьируется, и даже короткое общение может стать опасным:

https://ria.ru/20200327/1569188203.html

Но тем важнее умение отслеживать контакты.

0 / 0
Давайте жить позитивом

www.youtube.com/watch?v=8zak...

Очень  позититвный   ролик.  Во-первых,  все  по  делу  с  точки  зрения  медицины. 

Во-вторых,  с  разумной   долей   иронии. 

В-третьих,   -  стихи в   конце.    Если  нет  желания  смотреть весь  роли  -  последние    4  минуты must  see. 

0 / 0
И анекдот в тему ...

***
Испанская учёная-биолог:
- Вы платите в месяц миллион € футболистам и 1800 биологам. Теперь вы хотите вакцину. Ну так идите к Рональдо или Месси - они её вам отыщут.
***

0 / 0
Не открывается
0 / 0
Попробовал - работает. С другого компа тоже ...
0 / 0
У меня тоже работает

Спасибо, Петр Андреевич! Очень реалистичное изложение ситуации.

 

0 / 0
Заработало

Но на 1,5 часа меня не хватит, а последние 4 мин я не понял, о чём. Видимо, уже не соображаю.

0 / 0
А зря.

Полтора часа - не так много, а советы реалистичные и полезные.

0 / 0
Мне гораздо интереснее читать статью в Nature

Например, там говорится, что covid19 умеет хорошо связываться с рецептором ACE2 человеческой клетки, как и прежний SARS, но шипы, которые связываются с АСЕ2, у них разные. На этом основании делается вывод, что covid19 имеет естественнеое происхождение. Странная логика!

0 / 0
Продолжаю читать

Они сравнили геномы и шипы у вирусов из летучей мышки и ползучей ящерицы и получили, что мышкин вирус похож на covid19 целым геномом (96%), но отличается шипом и не связывается с человеческим рецептором, а у ящерицы геном другой, зато шип подходящий, и вот поэтому covid19 есть результат естественного отбора - и опять не понял, почему. Казалось бы, бери любой коронавирус и модифицируй его шип, что сделать, как пишут, совсем просто, и вот вам новый враг народа. Ведь вирус убивает не какими-то ядами, а самим фактом своего быстрого размножения в клетке, так что шип (и ген, который кодирует его белки в сайте связывания с рецептором) - это главное его оружие.

Прошу прощения за эти мало кому интересные подробности. Приятных просмотров роликов на ю-тубе!

0 / 0
Ну нет в геноме COVID-19

следов  генно-инженерных  манипуляций.    Очень  просто  переставить  ген  из     А  в   Б  -    но    сложно  внести  панель  точковых    замен.

1 / 0
Новый элемент генома

Завершая неинтересную конспирологическую тему, скажу лишь, что одно не исключает другое: например, шип модифицировали, а точечные мутации возникли позже, в результате естественнеой эволюции.

Гораздо интереснее находка, что геном covid19 содержит вставку (polybasic cleavage site), которой нет у других подобных вирусов. Назначение её неизвестно. Предполагается, что она возникает при передаче между людьми.

0 / 0
Южная Корея - рекордсмен

Да, в Ю. К. критичным оказался 31-й заражённый: с него началась эпидемия (ссылку не помню).

0 / 0
Динамика заболеваемости и смертности

Согласно данным, приведеным на сайте https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries , в последние две недели зависимость числа случаев от времени стала экспоненциальной, см. прикреплённый логарифмический график.

За две недели число заболевших в мире выросло в 4.3 раза, с 170 до 720 тыс., а число умерших в 5.2 раза, с 6.5 до 34 тыс. Если и дальше так пойдёт, то к середине апреля будет 3 млн заболевших и 180 тыс. умерших. 

0 / 0
Если

А если до 15 мая посчитать? Вроде как все на планете заразятся уже к этому времени при такой динамике. Тогда к середине июня все закончится или почти закончится, так или иначе...

0 / 0
Нельзя так считать

При передаче вируса между людьми происходит его адаптация к новому организму, и при этом почему-то патогенность снижается. Так что будем надеяться на лучшее.

1 / 0
Это на уровне "хотелок"

Это на уровне "хотелок". Этот вирус, действительно, очень быстро мутирует, вроде бы некоторые медики говорят, что у него мутации при каждом (!) цикле размножения. Отсюда гигантское число штаммов. Но оснований считать, что мутации приводят к снижению патогенности в данном случае вроде как нет никаких. Мозгов у вируса нет и у него нет цели адаптироваться к "хозяину". Какие механизмы при пандемии помогут вирусу адаптироваться так, чтобы не убивать хозяина? Ключевое слово- во время пандемии. 

На данный момент нет также особых оснований считать, что формула "удвоение за 3 дня" не будет работать- она во всех странах работает и пока-что не меняется. Исключение- Китай, там они вышли на плато в графике числа заболевших (новые случаи, как они утверждают, все "завозные"). Но можно ли этому доверять? 

0 / 0
Как быть с теорией эволюции на уровне генов?

"Но оснований считать, что мутации приводят к снижению патогенности в данном случае вроде как нет никаких."

Меня тоже это смущает. Согласно законам эволюции (читаем "Логику случая" Евгения Кунина) в популяции выживают, в основном, те мутации, которые приводят к росту выживаемости организма. Правда, согласно тому же автору, могут выживать и плохие мутации, если за время их жизни случится хорошая. В любом случае живучесть должна возрастать, а не убывать. К сожалению, выяснить этот момент не могу.

1 / 0
На длительных временах

"в популяции выживают, в основном, те мутации, которые приводят к росту выживаемости организма".

Я предполагаю, что это происходит, но только на длительных временах, именно поэтому и написал выше "во время пандемии", то есть локально во времени, и что у вируса мозгов нет. Локально во времени может произойти что угодно, в том числе и более летальные мутации. А чтобы всем заразиться нужно всего 1.5 месяца на данный момент и при имеющейся динамике. Вряд ли следует ожидать за такое короткое время снижения патогенности. Вероятно потом патогенность снизится, среди тех, кто останется. Группе риска, на мой взгляд, нужно полностью (!) изолироваться чтобы дождаться этого времени, когда патогенность снизится (если). 

Будем надеяться на лучшее, хотя пока-что оснований для этого нет.

1 / 0
Промоделируем ситуацию.

Есть   исходный   вирус   -    вариант  А.  Пациент с   этим  вирусом    заразил  двух   человек    двумя  мутантными вариантами  исходной   формы  -     сильно  патогенным  и  слабо  патогенным,  В    и  С.  Человек  с  сильно  патогенным  вариантом   В  быстро  попал  в  стационар   и  никого    по  дороге  не   заразил.  Или   заразил   пару  человек.  Вариант  С  вызывает  только   легкий  кашель.   В    итоге      этот     клиент    заразил  сам  того  не  ведая    много  человек.   В    итоге   в     общей  популяции    вируса  произошел   сдвиг в  сторону   менее  патогенного  варианта. 

0 / 0
Мутации

Логика понятна, хотя тут много "но" и предположений. В частности предположение, что человек с летальным вирусом сразу попал в стационар- у него есть симптомы, он социально ответственный и нигде не лазил, а медицинская система идеальна и его сразу взяла в оборот.

Вчера прошла информация, что вирус мутирует при каждом акте репликации, что делает его уникальным. Если это так, то вирус достаточно быстро,может быть за пару месяцев, переберет все эволюционные комбинации, причем за 2 месяца, вероятно, не единожды. Какое у него там время репликации? В том числе появится и вирус с максимальной летальностью, и с долгим бессимптомным, но заразным, инкубационным периодом. Будет и такой, который максимально приспособлен к сосуществованию с человеком. Ну и промежуточные варианты, которые мы, вероятно, пока-что наблюдаем.

Понятно, что это на уровне общих рассуждений, но тем не менее...

0 / 0
Понятно, что я взял крайности

Главное  -     вирус  с  высокой  патогенностью  будет  размножаться  в  популяции  хуже.   

Насчет    мутировании  при кажом акте  репликации  -   перебор,     хотя  мутирует   быстро.  Перебрать все      сложно  -  хотя   эволюция   быстрая, от  момента    заражения  до   первой   клиники   проходит  4-5   дней,  а  где-то  с  3  дня  можно  заражать      людей   вокруг.   В  итоге  за  месяц  прохиодит   около  10   передач   вируса  от   хозяина  к   хозяину.  Плюс   есть  еще   эволюция  внутри   организма  пациента  -  разные  клетки  эпителия   могут   быть  поражены   разными   вариантами  вируса в  результате  мутаций.  И   опять  же   те,  которые    сильно  поражают  эпителий  и  убивают  его  -    вымирают. 

0 / 0
Понятно, спасибо

Да, это понятно, что сильно летальный будет подавляться смертью хозяина. Но, опять-таки, на больших временах. А локально, без карантина, очевидно, зацепить может все-равно большие группы населения. Для распространения достаточно одной-двух передач вируса до смерти хозяина.

Насчёт мутаций информация пока-что противоречивая. Есть и исследования, в которых говорится о том, что у коронавируса, наоборот, мутаций меньше чем у гриппа. От этого, конечно, сильно все зависит. Если мутаций мало, то ситуация более прогнозируемая, но не факт, что конечный результат будет лучше.

0 / 0
при частоте мутаций 1х10-3

с одной стороны - меня всегда мучал вопрос - как такие нестабильные системы умудряются обладать стабильным отсутствием патогенности? А ведь там еще есть элемент комплементации, позволяющей дефектным вирусам поддерживать свое размножение в присутствии недефектных форм. Можно усомнится о доминирующей роли вирусов в коэволюции их паразито-хозяинных отношений.  Лично у меня другая точка зрения. 

Но есть и стабилизирующие моменты например, слишком сильно измененная РНК может иметь слишком сильные изменения в своей вторичной структуре чтобы связываться с белком N и упаковываться в капсид. Ну и прочие функционально-значимые замены в геноме..  На уровне эпидемий я бы предположил двойной механизм стабилизации (самоограничивания эпидемии). 1. отбор в направлении большей контагиозности и меньшей вирулентности приводит к тому, что менее патогенные формы распространяются быстрее и делают иммуным население до того как в эту местность доберется высокопатогенная форрма того же вируса. 2. в самом очаге, в условиях большой дозы заражения, происходит бурное накопление дефектных вирусных частиц которые могут размножаться только в присутствии недефектны вирусов или за счет феномена взаимной комплементации. Это ограничивает репродукцию высокопатогенных форм вирусов за счет интерференции. Возникновение минимальных заражающих единиц в виде пулов дефектных вирусов существующих только благодаря комплементации делает возможным эффективное заражение только при высокой дозе заражения, высокой плотности популяции, синхронности динамики инфекционного процесса у значительной части населения (чтобы пики вирусовыделения совпали). Любые санитарные меры тут будут очень эффективны а эпидемиологогическая диагностика затруднена т.к. на самом деле следствие вспышки это не попадание вируса в неимунную популяцию, а следствие синхронного вирусовыделения и всплеска концентрации вирусных частиц в окружающей среде. 

0 / 0
По мутациям.

По мутациям.

1) каждый акт репликации- мутация.

https://m.gazeta.ru/social/news/2020/03/30/n_14227369.shtml

2) мутирует медленнее гриппа.
https://ria.ru/20200329/1569315712.html

0 / 0
ССылке 2 я верю много больше, нежели первой Все-таки

врач-терапевт  в  данном     случае  тот  еще  источник  информации.  Но    думаю,  что  пока  еще  не  набрано  данных  по структуре    этого     вируса  -  особенно  в  сравнительном  анализе   вирусов       от  пациентов с  легкой   и  летальной   формами  заболевания    одного    возраста. 

1 / 0
Модель эпидемии Нейера для Москвы

Исследование Михаила Тамма с прогнозами развития эпидемии

https://meduza.io/feature/2020/03/30/v-moskve-vveli-zhestkie-karantinnye...

0 / 0
а можно из этой модели извлечь

сроки когда карантин станет излишним? Допустим в Италии мы имеем 50% инфицированность. Большая часть жителей в условиях самоизоляции уже заражены и являются бессимптомными носителями. Наблюдаемый прирост заболеваемости это, в таком случае, будет лишь процесс манифестации/генерализации инфекции. Важно вовремя убрать карантин чтобы угробленная экономика не задушила медицину. Кто-то из грамотных в математике людей может это сделать?

0 / 0
Что нового про модели пандемии COVID-19?

Прошел месяц со времени этой публикации. Интересно, нет ли новых результатов, не поменялись ли взгляды авторов? Сегодня известно гораздо больше о динамике вспышки COVID-19 в разных странах и эффектные выражения автора типа

"Принципиально важно понять, что в случае COVID-19 мы имеем дело с новым заболеванием, к которому нет иммунитета ни у кого. В таком случае ожидать, что болезнь самопроизвольно остановится, охватив всего 1 или 10 процентов населения, можно примерно с таким же основанием, как ожидать, что падающий вам на голову кирпич самопроизвольно остановится в воздухе, не долетев до вас метр или полтора. "

уже не кажутся такими уж убедительными. Другие публикации, например, про Сбербанковскую модель с искусственным интеллектом, прогнозирующую с точностью до трех-четырех знаков и потому постоянно ошибающуюся, убеждают еще меньше. Между тем, количество публикаций о COVID-19 уже перевалило за 10 тысяч. 

0 / 0
О лечении

Моя родственница, в прошлом врач скорой помощи, прислала из Америки ролик, в котором врач рассказывает о применяемой методике лечения. Вот что я понял.

Используют комбинацию hydroxychloroquine sulfate (plaquenil, противомалярийный) 200 мг внутрь 3р/д 10 дней + azithromycin внутрь 1 р/д, в первый день 500 мг, следующие 4 дня по 250 мг. График уровня вируса в крови: с приёмом только первого уровень падает до 50% на 6-й день, с приёмом обоих – до нуля на 5-й день.

Необходима консультация врача, т.к. есть значительные вредные эффекты, так что эта информация - только для специалистов, если у них её ещё нет.

0 / 0
в ветеринарии давно используют макролиды

при терапии вирусных пневмоний. Вопреки мнению некоторых медиков, что антибиотки при вирусных инфекциях вредны.. Наблюдали снижение вирусной нагрузки и при использовании макродидов при РРСС у свиней (возможно, следующий кандидат на межвидовой переход).  Однако там это может быть связано с подавлением макрофагов. Не следует ли что коронавирус тоже активно размножается в макрофагах легких? 

0 / 0
Азитромицин имеет весьма

Азитромицин имеет весьма специфическую ФК/ФД и накапливается в некоторых типах иммунных клеток специфично. На все макролиды я бы это не распространял.

Недавно наталкивался и на данные, что гликопептиды (типа ванкомицина) тоже могут быть ингибиторами некоторых вирусов.

Это примерно как та история, что пенициллин применяют при отравлениях грибами (конкурентно связывается с каким-то из ферментов печени и "смягчает удар"). Сложные природные и полусинтетические соединения и ведут себя довольно затейливо. А уж в живом-то организме - без эксперимента, на одних "общих соображениях",  тут далеко не уйдешь.

0 / 0
это понятно но

тилозин, отчасти тилмикозин  показывают неплохую эффективность при терапии виурсных инфекций также за счет взаимодействия с макрофагами. Клинический опыт есть, пусть и в ветеринарии. Я бы еще рассмотрел в этом качестве доксициклин, особенно на более ранних этапах процесса. Так как ингибирование металлопротез нейтрофилов создает перспективы для снижения отеков, миграции фагоцитов в очаг воспаления и, я бы не исключал, подавление протеолиза некоторых белков вируса в процессе их посттрансляционных модификаций. Клинические примеру эффективности как макролидов, так и доксициклина есть при вирусном перитониет кошек (а это смертельное заболевание), хорошая воспроизводимость при использовании доксициклина на фоне вирусных миокардитов и пневмоний на свиньях и курах. Можно конечно игнорировать этот опыт и самим побегать по граблям, но на это уйдет время. 

0 / 0
Китайские учёные о свойствах вируса

Lai20, февраль. SARS-CoV-2 (научное название нынешнего вируса) is closely related to two bat-derived (происходящих от летучих мышек) SARS-like (это название вируса, вызвавшего эпидемию в 2002 г.) coronaviruses, bat-SL-CoVZC45 and bat-SL-CoVZXC21. It is spread by human-to-human transmission via droplets or direct contact, and infection has been estimated to have mean incubation period of 6.4 days and a basic reproduction number of 2.24–3.58… The one case of SARS-CoV-2 pneumonia in the USA is responding well to remdesivir, which is now undergoing a clinical trial in China; Xie20, препринт. Potential treatments included remdesivir, chloroquine, tocilizumab

0 / 0
Динамика заболеваемости в России

Моя жена регулярно записывает данные о полном количестве и ежедневном приросте числа заболевших, сегодня я нанёс их на график в полулогарифмическом масштабе. Получились две прямые, которые свидетельствуют об экспоненциальном росте: каждые две недели оба числа увеличиваются примерно в 10 раз. Будем ждать, когда начнутся отклонения от этой линии вниз. А пока я отменил своё председательство в ГЭК на химфаке МГУ и более не пойду туда ни на заседания Совета, в котором состоял много лет и который уж год как закрыт и, видимо, не откроется вновь, ни для обсуждений с коллегами, которые теперь будут только по эл. почте.

Фейсбук регулярно напоминает мне, что я писал 5 лет назад. Тогда мой внук Миша принёс из школы анекдот. Иванов, do you speak English? – Чё? – Садись, два. Петров, do you speak English? – Yes, I do. – Чё? А вот современный. Толстая баба на Привозе спрашивает торговку: Скажите, пожалуйста, чем Вы кормите своих курей? – А Вам зачем? – Так ищу средство для похудения.

0 / 0
Причем самое неприятное, что российская кривая заболеваемости

пока четко выглядит как экспонента:

https://www.worldometers.info/coronavirus/country/russia/

В то время как в США, Испании и Италии виден некоторый разворот вниз (см. на том же сайте).

0 / 0
Биолог об особенностях коронавируса

"Он ведет себя необычно". Биолог об особенностях коронавируса:

https://www.svoboda.org/a/30525376.html

– Получается, что и "стадного иммунитета" тоже не будет? Можно заболеть, выздороветь и заболеть снова?

 

– Да, так и есть. Вирус мутирует и меняет свой "плащ". Если я заражаюсь вирусом в, так сказать, синем плаще и выздоровею, потому что у меня разовьётся к нему иммунитет, а потом этот вирус придёт ко мне в красном плаще, мой организм примет его за другой вирус и будет должен вырабатывать иммунитет и к нему. Судя по всему, это одно из самых неприятных свойств этого вируса.

0 / 0
да. у нас уже десятки лет

ушло на создание кучи вакцин. Постоянно идет отбор новых штаммов и серотипов, меняется тканевой тропизм (например, вирус уходит в антителозащищенные органы - почки), выходят на первое место патологии органов репродукции и всевозможные хронические болезни, на фоне тотальной вакцинации. Это если рассматривать в качестве примера коронавирус кур. Ну и если вирус преимущественно в кишечнике то антитела там не очень помогают защитить от циркуляции вируса. 

0 / 0
Интервью Летарова

Сегодня Андрей Викторович Летаров очень интересно рассказал про коронавирус nauka.vesti.ru, спасибо ему.

«Возможности синтетической биологии сейчас позволяют синтезировать практически любой вирус, и отличить синтетический вариант от природного будет невозможно – об этом рассказал в документальном фильме Наили Аскер-заде "Опасный вирус" на телеканале "Россия 1" директор государственного научного центра "Вектор" Ринат Максютов. https://russia.tv/brand/show/brand_id/64900/»

Он, в частности, рассказал, что все коронавирусы проникают в человека через дыхательные пути и быстро оказываются в кишечнике, откуда уже могут проникнуть в кровь. Так я получил ответ на свой вопрос о самозаражении: злого вируса в нашем кишечнике нет, пока он не попал туда извне.

0 / 0
Видеолекция Сергея Нетесова «Коронавирус: новые данные»
0 / 0
Статья в ЖЖ
0 / 0
Что-то невероятное

Пишет 6 апреля в Фейсбуке дбн проф. МГУ А.А. Константинов.

Мое сообщение подверглось сильному изменению со стороны фейсбука после публикации. Был удален почти весь мой текст... Исчезла и приведенная мной ссылка на ролик с заявлением министерства юстиции США 28 января 2020. Вот она еще раз https://www.facebook.com/remi.singh.948/videos/3537623566307597/ USA just discovered the man who manufactured and sold the #coronavirus to #China, Dr #CharlesLieber, head of the chemistry and biology department at #HarvardUniversity, USA. He was just arrested today according to American department sources. 

Фейсбук: Заключение. Частичная ложь. Информация в этой публикации представляет собой сочетание правдивых и ложных утверждений или является неполной. В некоторых частях эта информация является вводящей в заблуждение. Эксперты по проверке фактов из разных организаций… (непонятно, кто такие).

0 / 0
Действительно, чепуха какая-то...

Насколько можно понять из информации, приведенной на сайте этого департамента (Harvard University, USA), они не занимаются генетической инженерией вирусов.

Так что, типичный случай "fake-news".

0 / 0
Письмо из Гарварда

Да, в Иране это вообще на национальном телевидении заявляли. Все это фигня, он нанотехнолог и арестовали его за сомнительный прием огромного количества денег от Китайского правительства и консультирования в его пользу. Никакого короновируса он разработать в принципе не мог, хотя может его кто-то как свадебного генерала включал в статьи об этом.

0 / 0
Про БЦЖ

Удивляет, что в странах бывшего СССР, в Таиланде и Японии КВ распространяется медленнее, чем в Европе и США. Некоторые учёные объясняют это прививками БЦЖ против туберкулёза. Первое профильное исследование на эту тему было опубликовано в конце марта группой ученых из Нью-Йорка. «Наши данные дают основания предполагать, что вакцинация БЦЖ, по-видимому, значительно снижает смертность, связанную с Covid-19». Эпидемиологи из Университета Техаса провели еще более масштабное исследование, изучив статистику 178 стран, и пришли к тому же выводу (BCGversusCOVID-19). (Непонятно: в Испании были прививки, а там КВ гуляет. А в Италии их не было.) Тем не менее, числа инфицированных и умерших на миллион населения за период 9-24 марта ровно в 10 раз меньше в странах, где есть программы вакцинации БЦЖ.

0 / 0
скорость распространения

Сейчас смертность от коронавируса в России действительно низкая. А по числу новых случаев заражения в день Москва уступает только Нью-Йорку и Парижу.

0 / 0
Виднозапись семинара

Владимир! Есть ли видеозапись семинара про моделирование? 

0 / 0
другая лекция

Есть ли запись лекции Кабанихина мне не известно. НГУ выложил запись выступления Нетёсова на эту тему https://ngs.ru/more/69085504/

0 / 0
и там и сям речь идет по большому счету о хронических инфекциях

с нестерильным иммунитетом. Возможно именно перестраивание иммунной системы на борьбу с хроническим инфекционным процессом и помогает.  На этапе когда растет смертность мы можем размышлять уже скорее о продуктивном воспалении как и при туберкулезе. 

0 / 0
Отечественные статьи

Информация библиотеки Ногинского научного центра.

Доступ к естественно-научным журналам “Наука” в 2020 г. будет предоставляться на сайте “ИКЦ “Академкнига” (115 названий) https://sciencejournals.ru/catalog/alphabet/

Посмотрел «Биохимию», много доступных статей по КВ.

0 / 0
Две болезни

Пишет Yuri Goltsev, Stanford Medicine, https://www.facebook.com/io.einio/posts/2884554118266160

...коронавирусы данной подгруппы обладают довольно уникальной способностью задержать выработку интерферона. Он включается - но сильно позже...легкие уже поражены... Таким образом внутри нынешней коранавирусной инфекции есть две болезни. Первая болезнь - вирусная, она ранняя и проходит практически без проявлений. Она запускает вторую болезнь (отказ легких), но эта вторая в своем максимальном проявлении уже не зависит от первой...В дополнение ко всему. Коронавирус уникален достаточно большим геномом. Для поддержания генома такого размера используется система коррекции ошибок при репликации (у многих других вирусов ее нет). Одно из наиболее подающих надежды лекарств, ремдисивир, работает так - он специально встраивается в вирусную РНК, чтобы создать ошибки при копировании вирусного генома и таким образом заблокировать вирус. Так вот, похоже, что система коррекции ошибок способна вырезать ремдисивир из РНК и продолжать эффективно воспроизводить вирус.

0 / 0
Необычайно большая РНК

Торможение производства интерферона клеткой в ответ на вторжение вируса, а также его способность защищаться от лекарств (см. выше), – новые свойства этого вируса. Их можно сопоставить с необычно большим геномом, около 30 тыс. нуклеотидов в сравнении с обычной длиной РНК в несколько тысяч. Известно, что остов РНК (нить сахар-фосфат-сахар-..., на которую крепятся нуклеотиды) становится неустойчивым, когда длина цепи достигает тысяч звеньев. В процессе эволюции, когда для передачи информации потребовались более длинные цепи, возникла ДНК, в которой в качестве сахара вместо рибозы стала использоваться дезоксирибоза, не имеющая ограничений по числу звеньев. Но почему вирусная РНК не распадается? Известно, что она заключена в защитную оболочку (капсиду), видимо, поэтому. И что с такой гадостью можно сделать?

0 / 0
скорее вопрос - а сколько там распавшихся молекул?

это же и низкокопийный вирус, видимо не так уж он успешен в копировании своей длинной РНК. Насколько там актуальны дефектные вирусные частицы?  Возможно и использование малых интерферирующих РНК для лечения было бы перспективно.

Если отбор на наличие такого механизма как торможение индукции интерферона прошел, значит индукция синтеза интерферонов (некоторых) может быть эффективным или для профилактики заражения или для обеспечения развития иммунизирующей субинфекции на фоне интенсивного вирусного давления (например, у врачей, членов семьи больного).  Нет ничего более важного чем фармакопрофилактика осложнений при COVID 19. 

Ну и видимо надо подавлять Th1  но стимулировать Th2 в начале инфекционного процесса (по аналогии с кошками и учитывая клинический эффект гидроксихлороквина). Стимуляция и клеточного и гуморального иммунитета до заражения я бы тоже рассматривал как перспективный способ профилактики. Например споровыми пробиотиками на основе B/ subtilis (главное не пить при повышении температуры).

 

0 / 0
Вывод из свежей статьи в Nature Medicine: всем носить маски.

Почти половину инфицированных коронавирусом заразили те, кто «отлично себя чувствует». Это научно подтверждено

Около 44% пациентов заразились от людей, которые еще не проявляли никаких симптомов заболевания

https://meduza.io/feature/2020/04/17/pochti-polovina-lyudey-infitsirovannyh-koronavirusom-zarazhayutsya-ot-teh-kto-otlichno-sebya-chuvstvuet-eto-nauchno-podtverzhdeno

То есть необходимо носить маски при любых контактах, в том числе со здоровыми ...

Сама статья в Nature Medicine:

https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5

1 / 0
Бессимптомных гораздо больше

Проблема в том, что бессимптомных гораздо больше: по разным источникам в 5-20 раз больше, чем документированно инфицированных. И точных данных никак не получить, т.к. даже хорошие тесты недостаточно чувствительны: тест не показывает наличие носителей, а от человека уже можно заразиться.

См. статью в Science, где говорится о разных долях документированных. Так что чем больше будет в РФ применяться чувствительных тестов, тем больше будет доля бессимптомных. И потому обещания скорого плато что в РФ, что в США - это, увы, всего лишь успокоительные  лозунги. Наши предварительные результаты на основе простых математических моделей говорят, что при реалистических сценариях выход на пик возможен не раньше конца мая.

2 / 0
И тем ниже будут оценки

летальности.  В   Москве  пик   будет  раньше  -  конец  апреля-самое     начало  мая.   По   стране  очень  размазано  ...

0 / 0
меня эта размазанность в РФ и США смущает

или появлению первых зафиксированных случаев предшествует достаточно длительная циркуляция вируса с перезаражением от бессимптомных носителей или есть еще один путь распространения (например с продуктами питания). К сожалению пока я осознал что кривые распределения числа случаев по штатам США выглядят весьма странно и не увязываются с эпидемической волной и графом отражающим мобильность населения .. в общем гда бы взять данные по штатам за конец марта начало апреля? И по областям РФ в динамике?

1 / 0
Модели динамики COVID-19 по Москве и регионам

На днях появилась статья в арХиве Кольцовой и др. про Москву и регионы, arXiv:2004.10118

там данные берутся по ссылке [13] : https://ncov.blog/countries/ru/77/  (заменяйте 77 на номер региона). Но там берется простая мат.модель, логистическая, SI. Сейчас многие обсчитывают текущие данные для разных стран по моделям SIR и SEIR. При всей условности результатов, они дают качественные оценки, позволяющие оценить степень влияния разных факторов.

Например, наши подсчеты на основе SEIR говорят, что выход на пик в РФ должен произойти не в начале и не в середине мая, как внушают официальные лица, а в конце мая (под пиком  понимается точка максимума числа инфицированных, а не точка "взрыва", как трактуется это слово в комментарии Анны Поповой)

************************** 

Mathematical Modeling of the Spread of COVID-19 in Moscow and Russian Regions

Authors: E. M. KoltsovaE. S. KurkinaA. M. Vasetsky

AbstractTo model the spread of COVID-19 coronavirus in Russian regions and in Moscow, a discrete logistic equation describing the increase in the number of cases is used. To check the adequacy of the mathematical model, the simulation results were compared with the spread of coronavirus in China, in a number of European and Asian countries, and the United States. The parameters of the logistics equation for Russia, Moscow and other large regions were determined in the interval (01.03 - 08.04). A comparative analysis of growth rates of COVID-19 infected population for different countries and regions is presented. Various scenarios of the spread of COVID-19 coronavirus in Moscow and in the regions of Russia are considered. For each scenario, curves for the daily new cases and graphs for the increase in the total number of cases were obtained, and the dynamics of infection spread by day was studied. Peak times, epidemic periods, the number of infected people at the peak and their growth were determined. △ Less

0 / 0
Но уже сейчас ясно, что модель не работает

Достаточно   положить  данные  по  Москве  по    26.04  на  рисунок  из  статьи. 

0 / 0
о моделях развития эпидемии

В известных моделях развития эпидемии ключевую роль играет показатель R - сколько человек заражает один заболевший. Грубо говоря, если R>1, то число заболевших растёт экспоненциально, а если R<1, то эпидемия прекращается. А в реальных данных по многим странам можно видеть длительные периоды почти линейного роста числа заболевших. Мне кажется, что правдоподобное объяснение этого феномена предложенно А.Марковым в его блоге https://macroevolution.livejournal.com/282946.html   Предлагаю слегка модифицировать его рассуждения следующим образом. Во время карантина всё население делится на две группы пассивное население на самоизоляции с R<1 и активное с R>>1 медики, социальные работники и т.п. Активная часть населения общается с большим числом пассивных сограждан. Поэтому  можно считать, что каждый активный человек контактировал с заражёнными согражданами. Вероятность  заражения активного человека зависит в основном не от того со сколькими больными он общался, а от того насколько у него эффективные средства защиты. Кроме того, доля нераспознанных носителей вируса среди активной части населения зависит от эффективности средств обнаружения заразы и если эти средства не меняются, то остаётся примерно постоянной. Значит и количество ежедневно заражающихся  среди  пассивного населения остаётся примерно постоянным.

0 / 0
кто и как объяснит волнообразные кривые заболеваемости

и смертности. Например   https://www.worldometers.info/coronavirus/country/us/

Вот США хоть количество смертей, хоть пики новых  случаев -четкий семидневный интервал, форма пиков более или менее тоже воспроизводится. Это особенности работы медиков или особенности заражения ?

0 / 0
а нет у кого-нибудь более старых данных по регионам?

представляется возможным что низкая копийность вируса значительно снижает вероятность самоограничения вирусной инфекции за счет накопления дефектных вирусных частиц. Однако есть возможность опережающего распространения более контагиозных, но менее патогенных штаммов вируса. В этом случае можно ожидать более быстрого выхода на пик, но меньшей смертности. Нельзя исключить и более эффективного отбора форм вируса способных эффепктивнее преодолевать реакции иммунной системы. 

Новый конкурс РФФИ создает перспективы для сотрудничества математиков и ветеринаров-инфекционистов. Все-таки наш многолетний опыт борьбы с коронавирусными инфекциями стоило бы учитывать, тем более что мы с ними работали на очень больших популяциях животных и птицы, это редкость для большинства развитых стран мира. 

Мысли на этот счет выкладываю. Любой желающий может ими воспользоваться.

Также мы проводим эксперименты на двух вспышках коронавирусной инфекции кошек (FIP смертельная инфекция и гибнут 100 заболевших кошек из 100) нам удалось снизить вирусную нагрузку и стабилизировать состояния с помощью новых препаратов, еще не вошедших в медицинскую практику. В воскресенье будет начаты 4 эксперимента с другим коронавирусом но уже на курах, 4 разных препарата будем проверять. Все-таки организменный уровень, в сравнении с культурами клеток, имеет свои плюсы.   Некоторые из препаратов применяли на себе наши заразившиеся уже коллеги..  

 

0 / 0
Про кишечник

"Такая гипотеза объясняет и то, что признаки поражения кишечника являются одними из наиболее ранних при CoVID-19."

Является ли эта гипотеза общепринятой, или есть возражения? Можно ли на её основе сделать вывод, что массовое тестирование, профилактика и лечение лёгкой формы болезни должны сосредоточиться, в первую очередь, на кишечнике? Если так, то что этому мешает?

0 / 0
особых возражений нет

спустя некоторое время опявилось больше публикаций о наличии вируса в кишечнике. Но это вопрос в математике. В кишечнике есть в вирус, в легких есть вирус. Кишечник поражен не сильно.. Ну и что?! Вывод автоматически делается в пользу легких. Их надо лечить. Но! Такой подход уместен для высококопийных активно размножающихся вирусов. Если вируса немного, то преоцесс его перераспределения с кровью может иметь клиническое значение. 

второй момент. а как лечить с учетом наличия вируса в кишечнике? В медицине таких подходов нет вообще. В ветеринарии мы боюсь в этом пионеры. Лет пять-семь. Проблема в том, что вирусные кишечные инфекции мы лечили и профилактировали вироцидными веществами. Там все просто. Есть некое равновесие между репродукцией вируса и элиминацией из кишечника. Достаточно это равновесие немного сместить инактивировав часть вирусных частиц.. В случае с респираторной патологией все несколько менее очевидно. Но мои заразившиеся коллеги применяи ветеринарные препараты. Например, если девушка болела неделю с невысокой температурой и плохим самочуствием, потом выпила препарат и температура нормализовалась за ночь, то какова вероятность что сей процесс не случаен?  В общем тут тоже многое зиждется на математике. Нужно считать вероятности неслучайности процесса во взаимосвязи с откклонением длительности клинических проявлений на фоне применения препарата и во заимосвязи между улучшением клинического состояния и сроком после начала приема препарата.  Просто тогда упростились бы обоснования применения. Опыты на котиках вроде удачны но там для всех очевидна изначальная  локализация вируса в кишечнике. 

 

 

0 / 0
Интервью Андрея Викторовича

Вызов человечеству. Вирусолог Андрей Летаров о COVID-19, тестах и вакцине

https://www.svoboda.org/a/30564255.html

0 / 0
Дополнительная информация

Дорогие коллеги,

Ссылки на кое-какую полезную информацию мы разместили в Специальной сессии "Компьютерные подходы к борьбе с коронавирусом COVID-19" в рамках нашего Симпозуима "Биоинформатка и компьютерное конструирование лекарств", который проводится в онлайн режиме.

Можно ознакомиться.

 

0 / 0
Белки, отвечающие за патогенность

Академик Евгений Кунин и его коллеги нашли два белка, общие для патогенных штаммов, но отсутствующие в непатогенных

https://pcr.news/stati/evgeniy-kunin-est-li-obektivnye-kharakteristiki-genomov-i-belkov-vysokopatogennykh-koronavirusov-/

... есть ли какие-то объективные характеристики геномов и белков высокопатогенных коронавирусов по сравнению с низкопатогенными и непатогенными? ... Когда вы или программа смотрите на выравнивание последовательностей, то очень четко видно, когда туда что-то вставлено... мы кое-что нашли – статистически достоверные различия в двух белках. А именно: в так называемом нуклеокапсидном белке и, что особенно интересно и немедленно привлекает внимание, в белке спайка. Нуклеокапсидный белок – это белок, который находится внутри вирусной частицы и там одевает вирусную РНК. А спайк – это белок, который «торчит» с поверхности вирусной частицы, взаимодействует с рецептором клетки хозяина и отвечает за слияние вирусной мембраны с клеточной. Обнаружилась вот какая особенность: у этих высокопатогенных штаммов значительно более выраженные сигналы ядерной локализации нуклеокапсидных белков, а также их экспорта из ядра. Ядерная локализация – это когда протеин находится в ядре клетки. Зачем ему туда? А хрен его знает, зачем ему туда! Знал бы, так не скрывал. Какого черта он делает в ядре, мы не знаем, но известно, что он туда в каких-то количествах попадает. Путаница усугубляется тем, что усилен сигнал как ядерной локализации, так и выхода из ядра. Мы не знаем, «болтается» ли этот нуклеокапсидный белок между ядром и цитоплазмой сам по себе или вместе с вирусной РНК

0 / 0
Онлайн-собрание Отделения медицинских наук РАН

«Российская газета», Татьяна Батенева: https://rg.ru/2020/04/29/akademiki-poka-ne-znaiut-kak-spravitsia-s-covid-19.html

…индекс контагиозности 2-4…размножается в легких гораздо больше, чем SARS…проникнув в человека, он два дня вообще не подает признаков жизни… легкие он уже вовсю съедает. И заразным человек остается, даже поправившись и выписавшись из больницы…  где это видано, чтобы респираторный вирус передавался и воздушно-капельным, и контактным, и орально-фекальным путем одновременно - такой гибрид насморка, поноса и грязных рук. И во внешней среде живет нетипично долго для вирусов респираторных. А клинических форм имеет столько, что впору отнести его к новому классу вирусов - поражает легкие, сердце, сосуды, систему кроветворения, почки, нервы и, видимо, много чего еще. Наконец, почему-то убивает вдвое больше мужчин, чем женщин…по данным ВОЗ заражается коронавирусом до 20 процентов медперсонала. А по данным наших общественных организаций, Россия уже потеряла в этой войне 70 медиков…несмотря на вложенные большие деньги, попытки разработать вакцины от предшественника - вируса атипичной пневмонии (SARS) - закончились неудачей…Академик Зверев предложил для некоторых групп населения использовать уже разработанную в нашей стране бактериальную терапевтическую вакцину "Иммунновак ВП4"… Зверев также категорически развеял сообщения о том, что против COVID-19 эффективна прививка БЦЖ и полиомиелитная вакцина, но выразил уверенность, что все-таки новая вакцина должна быть живой. То есть ее надо создавать на основе настоящего коронавируса, хотя и ослабленного, а не комбинировать лишь отдельные его гены, как это принято в последние годы идеологами рекомбинантных вакцин…директор НИИ скорой помощи им. Склифосовского Сергей Петриков: В поисках способов спасения тяжелых больных в институте используют вентиляцию гелий-кислородной смесью - инертный газ является драйвером для переноса кислорода в пораженные доли легких… (сомнительное утверждение с точки зрения физики: 1) инертный газ не может соединиться с молекулой в основном электронном состоянии, нужно кого-то из них возбудить; 2) даже если соединились, как может маленький атом тащить за собой тяжёлую молекулу? У него есть собственный двигатель? Свободный гелий диффундирует быстрее, потому что лёгок, но его соединение с кислородом будет менее подвижно, чем свободный кислород; к тому же оно быстро потеряет электронное возбуждение и развалится)… Рассказал директор Склифа и о загадочной прон-позиции - это когда пациент с пневмонией лежит на животе. Оказывается, этот простой прием позволяет задействовать те отделы легких, которые обычно при дыхании не используются… информация о повторном заражении коронавирусом, появившаяся в зарубежных источниках, маловероятна. Скорее всего, речь может идти о хроническом процессе. А это, вообще-то говоря, сенсация! Не слышно было прежде о респираторных вирусах, становящихся хронической патологией… непонятно, как вирус проникает в кровоток.

0 / 0
Интервью вирусолога Евгения Кунина

«Это патологический бред» Интервью вирусолога Евгения Кунина, которое нужно отправить всем, кто думает, что коронавирус создан искусственно

https://meduza.io/feature/2020/05/01/eto-patologicheskiy-bred

0 / 0
Гелий-кислородная смесь против COVID-19

https://www.ridus.ru/news/326039

«Веществом с соотношением гелия и кислорода 70 к 30, нагретым до максимально убийственной для вируса температуры 92 градуса, нужно дышать в течение 15 минут.»

Могу предположить, что гелий нужен для понижения теплоёмкости смеси, благодаря чему лёгкие не повреждаются высокой температурой. Но это опять-таки уничтожение самого вируса, а не лечение повреждённых лёгких, см. статью Юрия Гольцева в ТрВ от 21.04.2020 и в ОНР

http://onr-russia.ru/comment/19373#comment-19373 .

0 / 0
Уточнение

30% кислорода – это обогащённая смесь по сравнению с 21% в воздухе.

0 / 0
Прогнозирование COVID-19 в России

После долгих колебаний я решил все-таки опубликовать заметку о прогнозировании развития COVID-19 в России на сайте ОНР. Происходящее сейчас с человечеством требует научного осмысления и участия ученых различных специальностей. Возникающие проблемы междисциплинарны и открытое обсуждение методов и результатов может привести к новому пониманию и новым научным контактам.

В публикуемой работе представлены результаты построения математической модели развития эпидемии заболевания, вызванного коронавирусом COVID-19 на основе статистических данных по заболеваемости в России с 10 марта по 20 апреля 2020 г. Рассмотрены две классических простых модели эпидемиологии: SIR и SEIR. Проведена оценка  параметров моделей по опубликованным статистическим данным. Построены варианты прогноза развития заболеваемости в Российской Федерации на 120 дней при изменении параметра социальной дистанции, соответствующего различным режимам изоляции населения (карантина) и параметра $\alpha$, определяющего долю недокументированных случаев заражения.

 
Проведенные расчеты показывают, что модели SIR и SEIR могут быть использованы в условиях
ограниченного объема и недостаточной достоверности статистических данных. Они позволяют давать не только качественные, но и  количественные прогнозы процессов распространения вируса. В частности, из расчетов следует, что пик числа инфицированных в России следует ожилать не ранее конца мая. Результаты прогноза могут  использоваться для оценки эффективности режимов самоизоляции, для выбора оптимальной стратегии, например, путем периодического усиления и ослабления карантинных мер \cite{Eubank20} и т.д.
 
Отметим, что в марте-апреле 2020 г. в СМИ  неоднократно высказывались, со ссылкой на официальных  лиц различные предположения о времени наступления "пика" или "плато" распространения вируса COVID-19 в России, причем оценки менялись в течение нескольких дней \cite{TASS-07-04-20,RIA-20-04-20,RIA-29-04-20,RBC-04-05-20}. В середине апреля говорили о наступлении "пика" в конце апреля или начале мая 2020 г, в конце апреля и начале мая говорили о пике в середине мая. Однако результаты прогноза по SEIR модели, построенной по данным с 10 марта по 15 апреля.показывают, что такая "устаревшая" модель прогнозирует пик заболеваемости не менее точно, на 45-й день или также на конец мая. Было бы желательно публичные предположения и рекомендации сопровождать публикацией доказательств и вычислений, на которых рекомендации основаны. Ссылки на использование искусственного интеллекта в моделях без подробных пояснений \cite{{RIA-29-04-20}} вызывают скорее подозрения, чем доверие.
 
Также хочется отметить, что расчеты проводились при ряде дополнительных предположений: считалось, что всё население страны восприимчиво к вирусу, вирус не обладает сезонностью и т.п. При таких предпосылках итоговым сценарием является то, что в конечном итоге переболеет значительная часть населения, изменяется только темп распространения болезни.  В реальности же распространение инфекции может быть ограничено какими-то факторами, которые в настоящий момент неизвестны и здесь не учитывались.
0 / 0
Расчёт для Китая

Есть похожий расчёт для Китая. Главный качественный вывод очевиден и без расчётов: карантинные меры замедляют развитие пандемии, что снижает нагрузку на медиков и повышает эффективность лечения, но растягивают процесс во времени, что подрывает экономику и подавляет психику; последнее чревато бунтами.

0 / 0
Что надо знать властям о COVID-19

Итак, наступил конец мая и только сейчас стали заметны признаки замедления роста эпидемии COVID-19 в РФ, как и было предсказано в статье, опубликованной на сайте ОНР. Статья лежит на сайте уже почти месяц, она была написана на основе данных, опубликованных 15 апреля и 20 апреля 2020 г. Из этого можно сделать два вывода.

  1. Даже простые, классические модели развития эпидемий способны предсказывать время наступления качественных изменений в динамике эпидемии. Причины этого понятны, их можно обсуждать в научных изданиях.
  2. Заявления официальных лиц, появлявшиеся в СМИ в апреле и в начале мая о том, что пик эпидемии наступит в конце апреля, в начале мая, в середине мая, мягко говоря, не соответствуют действительности. Возможно, заявления делались, чтобы успокаивать народ, но ученые должны знать и понимать, что происходит на самом деле. К сожалению, многолетний опыт учит, что властям надо не доверять, а проверять их. 

 Неприятно, что в ряде официальных заявлений  говорилось, что прогнозы основаны на данных ученых, лучших математиков и биологов страны.  Цитирую сообщение ТАСС от 7 апреля 2020 г.:

МОСКВА, 7 апреля. /ТАСС/. Ситуация с распространением коронавируса в России выйдет на плато примерно через 10-14 дней, сообщила глава Федерального медико-биологического агентства Вероника Скворцова во вторник в интервью телеканалу "Россия-24".

... "По данным лучших групп прогнозирования, состоящих из математиков, биологов, - их несколько  есть в нашей стране, - где-то нам 10-14 дней до выхода на плато с этой инфекцией. После этого какое-то время мы продержимся на плато и пойдем в обратную сторону,  то есть фактически процесс, как правило, напоминает синусоиду", - сказала она.

Предлагаю этим "лучшим группам" представить свои расчеты публично, хотя бы, чтобы снять подозрения с остальных специалистов.

К сожалению, стремление властей скрыть правду, уменьшить масштаб опасности, заметно и на уровне отдельного заболевшего. Мне (думаю, что и другим) известны случаи, когда врачи отказываются делать тесты на коронавирус, а результаты тестирования не сообщают пациентам по 2-3 недели. Несколько моих знакомых не могли добиться проведения тестирования, пока не сделали самостоятельно платное КТ обследование. К сожалению, лицемерие и вранье глубоко проникли в российское общество. Со времен Салтыкова-Щедрина мало что изменилось.

Поэтому обязанность ученых еще и еще раз предупреждать власти, что правду лучше говорить и говорить вовремя, поскольку тяжесть последствий вранья со вроеменем возрастает.

 

1 / 0
Все модели врут ...

В  случае    России     есть     две  разные   динамики  -    Московская    и   остальная.   В  целом      в  мае        начниая  с  начала  мая   мы  стоим  на   одном  уровне    -    9000-10000  новых  случаев в  день.   При  этом  Москва  падает   -  а  остальная   страна  растет.  В   Москве  пик   был  в  районе   10  мая.   и  с  тех  пор  город    снижается.   Остальгна  страна    растет. -  в  начале   мая  на  Москву  приходилось    50%    всех   новых  случаев,   а  сейчас   31.05  -   примерно  27%

0 / 0
Да, но нет модели - нет прогноза.

Петр Андреевич, согласен с Вами все модели врут. Но если Вы захотите построить прогноз (любой величины), то Вы непременно будете использовать какую-то модель. Даже если Вам кажется, что Вы обходитесь без модели, то на самом деле Вы без нее не обходитесь. Смысл того, о чем я написал, в том, что для прогноза времени пика эпидемии можно обойтись простыми классическими моделями SIR и SEIR. Данные в них можно подставить любые: Москвы, Питера, России, любого региона или всех вместе. Данные публикуются для любой страны - подставляйте.  Смысл в том, что не нужно выдающихся математиков и биологов. И не нужно слушать официальные прогнозы. Проверьте сами. Это просто. У меня студенты считают.

0 / 0
Chemical & Engineering News, May 1, 2020

За прошедшую неделю большие фармкомпании (Gilead, Novartis, Schrödinger, Takeda Pharmaceutical, and WuXi AppTec) договорились о том, что будут делиться идеями, ресурсами и данными с целью создания антивирусных препаратов. Это не коммерческий, а чисто филантропический проект, все результаты будут доступны обществу.

Novartis уже исследует возможность блокировки главной протеазы коронавируса MPro… Такое лекарство было бы действенно против любого патогенного коронавируса, намтоящего и будущего. Ещё одна интригующая особенность главной протеазы – цистеин в её активном сайте, координирующий всю химию… https://cen.acs.org/biological-chemistry/infectious-disease/How-big-pharma-firms-quietly-collaborating-on-new-coronavirus-antivirals/98/i18?utm_source=NonMember&utm_medium=Newsletter&utm_campaign=CEN

0 / 0
Интересные подробности международного сотрудничества

Schrödinger is conducting virtual screens of billions of molecules to find ones that can dock to the SARS-CoV-2 main protease… After scientists synthesize those compounds and test them for their ability to stop the virus in the lab, they enter the data into the computer, which uses the information to generate a new set of molecules to test. And that’s all done in real time so that everybody has access to the database… Takeda researchers, which have access to Schrodinger’s software, conducted a virtual screen of the main protease… These main-protease inhibitors complement the covalent inhibitors Novartis is developing. An agreement allows Takeda to transfer compounds to Novartis to test its own assays… Takeda is now going through the same type of exercise with Gilead, but with a focus on RNA polymerase – the target of Gilead’s remdesivir.

К сожалению, наши не участвуют.

0 / 0
Ну, почему же...

Мы включились а этот "Challenge":

Joint European Disruptive Initiative against Covid19 Grand Challenge:
Virtual screening of the Billion Molecules.

Пока результат еще не получен, работаем над этим.

Но опыт анализа "Big Chemical Libraries" у нас есть (см. статья Савосиной
в приложении).

Этот опыт мы намереваемся применить в новом "Challenge".
5 / 0
С Днем Победы!
Мир без России: проблемы, которых бы не было

Виктор Мараховский

"Если бы нацисты победили, 2020 год выглядел бы совершенно иначе, —
утверждает издание Wasington Examiner. — Коронавирус был бы последней из
наших проблем".
В статье, посвященной 75-летию победы над Германией, автор поясняет, чем
был бы плох 2020 год в такой альтернативной вселенной: "Евреи, цыгане и
носители психических заболеваний давно бы исчезли. Африканцы наверняка
снова были бы рабами, многие другие также были бы порабощены, до смерти
работая на различные проекты нацистов. Свобода была бы фикцией".

Трудно представить себе более ложное перечисление "проблем параллельного
2020 года".
Нет, чисто по фактуре все верно — и было бы даже хуже.

Вся штука в том, что если бы нацисты победили, то в истреблении народов и
инвалидов, а также порабощении целых рас никто в передовом мире просто не
видел бы никакой проблемы. Как почти никто там не видел в этом проблемы до
Гитлера.

Вообще в современной — особенно современной западной — "популярной
истории" принято считать, будто Гитлер спустился на Европу на зонтике. То
есть в результате несчастного стечения обстоятельств, без каких-либо
предпосылок.
То есть сначала континент Эмиля Золя, Льва Толстого и Томаса Манна
спокойно развивался себе в сторону гуманизма и равенства, а потом по
нелепой случайности угодил в Первую мировую войну — и из-за нее Европа
сломалась. На востоке пришли к власти большевики, а в Германии — внезапные
нацисты, внезапно провозгласившие себя высшей расой и пожелавшие захватить
весь мир. Но Свободные народы запада (фраза Толкина, но "Властелин колец"
же тоже не с неба упал) объединились и победили Гитлера, и спасли евреев и
цыган от уничтожения, а многие народы (кроме восточноевропейцев,
захваченных большевиками) от порабощения.

Так вот. Достаточно посмотреть на карту предгитлеровской Европы, чтобы
понять, как все было на самом деле и что случилось бы, получись у Гитлера
реализовать его планы.

В начале XX века, строго говоря, мир был распилен между очень небольшим
количеством колониальных держав, они же передовые цивилизованные нации.
Можно ли было удивить эти нации захватническими войнами?

Об этом стоит спросить у англичан, с середины XIX века ходивших огнем и
штыком по Китаю и силой принуждавших его умирать от опиума.

Можно спросить у французов, заглотивших пол-Африки и пол-Индокитая.

Можно спросить даже у малютки Португалии, после утраты Бразилии все же
владевшей до второй половины XX века колониями, в несколько раз
превышающими ее по площади и населению.

Можно ли было удивить эти нации расизмом и геноцидом?

Об этом можно спросить у короля крошки Бельгии Леопольда, в начале XX века
(когда Гитлер еще рисовал акварели) вырезавшего десяток миллионов негров в
своей личной колонии Конго.

Об этом можно спросить у Уинстона Черчилля, приятного толстяка и
величайшего британца по версии британского парламента (2002). "Я, к
примеру, не признаю, что по отношению к краснокожим индейцам Америки или
коренному населению Австралии совершено какое-то преступление. Более
сильная раса, лучшая раса, более мудрая раса — назовем это так — пришла и
заняла их место", — отвечает нам сэр Уинстон.

Об этом можно спросить, наконец, у американцев, вскоре после решения
индейского вопроса захвативших Филиппины и уничтоживших около миллиона
непослушных филиппинцев. "Наши люди безжалостны, они уничтожают мужчин,
женщин, детей, пленных и захваченных, активных повстанцев и подозреваемых
в содействии, начиная с детей десятилетнего возраста. Преобладает идея,
что филиппинец как таковой немногим лучше собаки", — констатировал
американский корреспондент из Манилы в 1901 году.

Можно ли было удивить этих людей рабством и жестокостью?

Можно спросить об этом у восставших американских горняков, которых в 1921
году власти в союзе с ЧВК бомбили с аэропланов.

Чем, черт возьми, могли поразить всех этих цивилизованных людей расправы
Гитлера с евреями и цыганами — а уж тем более с русскими?

Заметим, что хотя чисто арифметически гитлеровцы убили больше всего именно
русских, а в известном генеральном плане "Ост" предусматривалось почти
полное истребление великороссов (в отличие даже от поляков, которых
планировалось лишь выселить с глаз долой, "потому что геноцид поляков
европейцы не поймут и немцам будет стыдно") — традиционно русские даже не
включаются западными обличителями нацизма в число главных его жертв. Вот и
автор Washington Examiner пропустил — может, просто не знал, может, ему
плевать. Тот факт, что японцы истребили десятки миллионов китайцев, тоже
остается незначительной абстрактной и малоизвестной цифрой — по сравнению
с огромным и трагичным Пёрл-Харбором (2,4 тысячи погибших американцев).

Так что нет, никакой геноцид не был бы проблемой. И рабство не было бы
проблемой. А уж евгеника точно не была бы проблемой — потому что
цивилизованные нации широчайше занимались стерилизацией своих
"неполноценных" с начала XX столетия и кое-где чуть ли не до его конца.

Если бы гитлеровская Германия, как и хотела, победила на Востоке —
современный мир всего лишь был бы старым добрым миром начала XX века,
только на анаболиках. Без России — небольшие остатки русских, белорусов и
украинцев трудились бы в рабстве у новых юнкеров под присмотром
онемеченных и ужасно гордых этим приказчиков-прибалтов. Без Китая — может
быть, до сих пор существовала бы марионеточная Маньчжурия. А в остальном
все было бы вполне привычно.

Никакой "войны до последнего нациста" или "до последнего свободного
американца/британца" тоже бы не было. Потому что к концу 1940-х все
крупные державы, как и в нашем мире, уже наверняка получили бы по ядерной
бомбе, а к 1960-м годам установился бы ядерный паритет. Войны бы, конечно,
по-прежнему велись — но в основном в третьем мире и руками аборигенов.

Еще раз повторим главное: в результате поражения нацистской Германии мир —
в том числе западный мир — изменился гораздо сильней, чем изменился бы в
результате ее победы.

Именно потому, что нацизм, несмотря на весь свой якобы модернизм — в
действительности выступал наемником очень старой и традиционной, "прежней"
Европы и "прежнего" Запада. И многим, очень многим на Западе это вполне
нравилось.

То, что сейчас гитлеризм вызывает ужас, то, что расизм делает человека
маргиналом, то, что открытые захватнические войны больше не в моде — не
результат естественного развития западной цивилизации.

Это результат того, что однажды, 75 лет назад, на стене Рейхстага
появились рядом надписи "Мы из колхоза Рязань Суховерхов", "Запомнят гады
путь от Грозного до Берлина" и "Здесь были из Ленинграда майор Зверев,
Охрименко, Михайлин".

Именно эти люди — эти и миллионы других наших людей — не дали миру в
очередной раз вернуться в прошлое, в старые добрые времена хищничества и
рабовладения.

Именно они силой вырвали мир в будущее.

Именно они, в сущности, создали тот 2020 год, в котором зверству и
хищничеству можно ужасаться.

https://ria.ru/20200509/1571164753.html
1 / 0
Полезное напоминание

Всё это хорошо нам известно, но напоминать нужно. «Вообще в современной – особенно современной западной – "популярной истории" принято считать, будто Гитлер спустился на Европу на зонтике. То есть в результате несчастного стечения обстоятельств, без каких-либо предпосылок.» Я бы дополнил рассуждения атора про предпосылки, чтобы придать им завершённость. Стремление к самоуничтожению – это и есть главная черта человеческой популяции, которая по всем признакам не переживёт текущее столетие. Лютая ненависть и жесточайшие войны существовали всегда, но результаты были не столь чудовищны, как в 20-м веке. Научно-технический прогресс привёл не только к росту уровня благосостояния и, как следствие, продолжительности жизни, но также и к взрывному росту мощи средств массового уничтожения людей и природы. Оба фактора смертельны, недаром во Вселенной нет других цивилизаций. Сейчас уже представляется несомненным, что существуют планеты с подходящими для жизни условиями и что при наличии условий жизнь возникает со стопроцентной вероятностью. Пока она примитивна, её нельзя обнаружить с Земли, а технически развитая цивилизация долго не живёт.

C Днём Победы!

0 / 0
Илларионов - интересное интервью о короновирусе
0 / 0
цифровые издевательства для заболевших
0 / 0
нда уж

вот это очень может быть. зная о легкости "отмывания" всякими системами и программами - очень даже запросто. А кто-то из знакомых попал в короновирусную ситуацию в столице нашей родины? (вне столицы ничего не всучают) у них есть это приложение?

1 / 0
К вопросу об эпидемиях и не только

Владимир (Мордехай-Зеэв) Аронович Хавкин (1860 - 1930 гг.)

Каюсь, не знал.

https://toldot.ru/articles/articles_31963.html

Страницы