Сборники материалов конференций по автоматическому управлению в Интернете

Сегодняшняя информация Александра Львовича о Конгрессе в Кейптауне натолкнула меня на мысль также поделиться личными впечатлениями об организации симпозиума в Санкт-Петербурге – 20-го Европейского симпозиума по анализу взаимосвязей структура-активность (EuroQSAR-2014 – www.euroqsar2014.org). Конечно, масштабы Конгресса и Симпозиума различны, но, тем не менее, симпозиумы EuroQSAR - это главное научное событие в области компьютерного дизайна лекарств, агрохимии и химической токсикологии, традиционно проводимое в различных Европейских странах раз в два года, начиная с 1973 года.

В 1964 году, примерно 50 лет назад, Корвин Ханч и Тошио Фуджита опубликовали в Журнале Американского химического общества знаменитую статью “Ро-сигма-пи анализ. Метод для оценки корреляции между биологической активностью и химической структурой”. Согласно данным Web of Science, эта первая публикация с описанием общего метода дизайна лекарств на основе структуры лигандов была процитирована свыше 2000 раз. В PubMed на текущий момент опубликовано более 170 тысяч работ, связанных с анализом взаимосвязей структура-активность, которые выполнены тысячами исследователей в мире за истекшие 50 лет.

Обширные исследования пространственной структуры белков, развитие компьютерной техники и расчетных методов привели к созданию базы для молекулярного моделирования, которое позволяет получить механистическую интерпретацию взаимодействия лиганда с мишенью. В настоящее время методы, основанные на структуре лигандов, на структуре мишени, и комбинированные методы широко используются в поиске и оптимизации новых «соединений-лидеров» с улучшенными фармакодинамическими и фармакокинетическими характеристиками.

Развитие высокопроизводительных постгеномных технологий привело к лучшему пониманию молекулярных механизмов возникновения патологий. Достижения в области синтетической органической химии привели к созданию большого количества химических «реагентов», использующихся для изучения биологических процессов в норме и при патологиях. Стало очевидно, что большинство биологически активных веществ взаимодействует с многими молекулярными мишенями и проявляет плейотропное фармакологическое действие. Более того, оказалось, что из-за сложных регуляторных сигнальных процессов в клетке, взаимодействие с определенной мишенью не всегда приводит к возникновению желательного эффекта; таким образом, возникла необходимость в изучении «Сетевой фармакологии», «Хемогеномики», «Химической биологии».

Поэтому общей идеей впервые проводимого в России симпозиума EuroQSAR-2014 (Санкт-Петербург, 31 августа – 4 сентября 2014 года) стало «Понимание химико-биологических взаимодействий», что позволило не ограничиваться узкоспециализированными проблемами в области QSAR и молекулярного моделирования, но также осветить современные направления, включая представление, визуализацию и навигацию в химико-биологическом пространстве, хемо- и биоинформатические подходы к мультитаргетному (Q)SAR, моделирование белок-лигандных взаимодействий, роль компьютерной токсикологии в оценке безопасности лекарств и химических веществ, трансляционную биоинформатику, новые методы QSAR и моделирования.

Когда четыре года назад на EuroQSAR-2000 зарубежные коллеги предложили мне заняться организацией симпозиума в 2014 году в России, мне эта идея показалась достаточно безумной, чтобы согласиться. Тем более, что у меня уже был опыт организации и проведения симпозиума CMTPI-2007 в Москве в 2007 году (www.ivtn.ru/cmtpi-2007). Были сомнения, где проводить симпозиум, в Москве или в Санкт-Петербурге, которые в итоге разрешились в пользу Санкт-Петербурга, как культурной столицы и одного из крупнейших научных центров России.

У меня не было иллюзий относительно возможностей привлечения спонсоров, поэтому за полтора года до симпозиума к его организации была привлечена LD Organisation – бельгийская фирма, специализирующаяся на организации международных конференций и симпозиумов, имеющая обширные связи с международными фармацевтическими компаниями. Кроме того, нужно было найти научные учреждения или университеты в Санкт-Петербурге, которые согласились бы принять участие в организации симпозиума. Санкт-Петербурггская химико-фармацевтическая академия (ректор – профессор И.А. Наркевич) и Национальный исследовательский университет информационных технологий, механики и оптики (ректор – профессор В.Н. Васильев) откликнулись на призыв, и любезно согласились войти в число организаторов EuroQSAR-2014. Позднее в число организаторов был включен Комитет по науке и высшей школе Правительства Санкт-Петербурга (председатель – А.С. Максимов).

В ноябре 2013 года предстоящий 2014 год был объявлен Годом науки ЕС-Россия (http://eu-russia-yearofscience.eu) и, естественно, возникла мысль, что EuroQSAR-2014 должен войти в число официальных событий данного мероприятия. Министерство образования и науки данную инициативу поддержало, и также вошло в число организаторов симпозиума EuroQSAR-2014.

Были сформированы Организационный комитет, Программый комитет и Локальный оргкомитет; определена основная тематика симпозиума и перечень приглашенных докладчиков. Конечно, было много рутинной работы, переписки с многочисленными коллегами, но, в результате, удалось пройти весь путь по организации симпозиума практически без потерь. Правда, в марте 2014 года в среде зарубежных участников симпозиума возникли «брожения», связанные с общей политической ситуацией, которые удалось приостановить, разместив на веб-сайте EuroQSAR-2014 специальное письмо председателя организационного комитета с соответствующими разъяснениями (http://www.ldorganisation.com/v2/content.php?langue=english&cle_menus=1238915883).

Интересно, что в июле 2014 года мне позвонил по телефону корреспондент одного из зарубежных изданий и долго выспрашивал, как сказались санкции против России на организации нашего конгресса, много ли участников отказались приехать и т.п. Вынужден был его разочаровать: потери, конечно, были, но обусловлены они были изменившимися личными обстоятельствами 1-2 участников. Даже российские визы, на этот раз, получили все зарегистрировавшиеся участники!

В симпозиуме приняло участие 271 человек,включая ученых, специалистов, аспирантов и студентов из 38 стран: Россия – 78 человек; Германия – 32 человека; США – 18 человек; Швеция, Италия, Япония – по 12 человек из каждой страны; Франция – 10 человек; Бельгия, Испания – по 8 человек из каждой страны; Австрия, Южная Корея - по 6 человек из каждой страны; Китай, Эстония, Швеция - по 5 человек из каждой страны; Болгария, Чешская республика, - по 3 человека из каждой страны; Украина, Австралия - по 2 человека из каждой страны; по одному человеку из каждой страны – Алжир, Армения, Беларусь, Бразилия, Греция, Дания, Израиль, Индия, Иран, Казахстан, Куба, Кыргызстан, Македония, Нидерланды, Сербия, Финляндия, Южно-Африканская республика. 43,2% участников симпозиума было представлено учеными из академических институтов и университетов; 26,4% - специалистами, работающими в промышленности; 30,4% - студентами, аспирантами и постдоками.

Важным компонентом симпозиума EuroQSAR-2014 стала Школа-семинар для молодых российских ученых по методам компьютерного конструирования лекарств, которая была проведена 28-30 августа 2014 года на базе Санкт-Петербургской химико-фармацевтической академии (www.euroqsar2014.ru). В школе-семинаре приняло участие около 130 ученых, аспирантов и студентов из различных регионов, включая: Санкт-Петербург, Москву, Архангельск, Барнаул, Волгоград, Всеволожск, Ереван, Казань, Черноголовку, Минск, Москву, Нижний Новгород, Новосибирск, Пущино, Севастополь, Сертолово, Сыктывкар, Таганрог, Томск, Чебоксары, Ярославль.

Для участников и организаторов симпозиума оказалось приятной неожиданностью, что на открытие симпозиума 31 августа в воскресенье в Санкт-Петербург прилетела на несколько часов заместитель министра образования и науки РФ Л.М. Огородова, и обратилась к присутствующим с приветствием на английском языке. Также на открытии симпозиума выступили первый заместитель председателя Комитета по науке и высшей школе Правительства Санкт-Петербурга И.Ю. Ганус, ректор Санкт-Петербургского государственного национального исследовательского университета информационных технологий, механики и оптики профессор В.Н. Васильев, ректор Санкт-Петербургской государственной химико-фармацевтической академии профессор И.А. Наркевич.

С пленарной лекцией «Анализ взаимосвязей структура-активность: учимся всю жизнь» выступил один из основоположников современного QSAR, Тошио Фуджита (Университет Киото, Киото, Япония), с публикации которого совместно с Корвином Ханшем в JACS в 1964 году ведет начало современный QSAR.

Не стану пересказывать здесь всю обширную научную программу симпозиума, скажу лишь, что лекторы были подобраны первоклассные, о чем свидетельствовали отзывы многих участников. Если у кого-то возникнет конкретный интерес, готов прислать по электронной почте PDF с отдельными презентациями (целиком программу симпозиума можно посмотреть на веб-сайте www.euroqsar2014.org). Также планируется предоставить доступ к копиям презентаций в личном кабинете на веб-сайте школы-семинара (www.euroqsar2014.ru).

Российскими участниками симпозиума EuroQSAR-2014 было представлено 4 устных доклада: Н.С. Зефиров (Химический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова, Москва) «Молекулярный дизайн бивалентных лекарств и препаратов двойного действия», О.А. Раевский (Институт физиологически активных веществ, Черноголовка) «Предсказание растворимости в воде in silico, от случайных глобальных моделей к локальной регрессии, индивидуальной для каждого анализируемого химического вещества», А.А. Лагунин (Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва) «Подходы системной химической биологии к выявлению мишеней лекарств, взаимодействие с которыми приводит к возникновению кардиоваскулярных побочных эффектов», В.А. Палюлин (Химический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова, Москва) «Топологический анализ молекулярного пространства (MFTA) как инструмент для мультизадачного QSAR».

Российские участники также приняли активное участие в постерной сессии. По 9 постеров было представлено коллегами из Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова и Института биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича; Институтом биохимической физики имени Н.М. Эммануэля было представлено 5 докладов; Институтом физической химии и электрохимии имени А.Н. Фрумкина 4 доклада; Институтом элементоорганических соединений имени А.Н. Несмеянова, Санкт-Петербургским государственныи технологическим институтом, Московским физико-технический институтом, Институтом физиологически активных веществ, Институт нефтехимического синтеза имени А.В. Топчиева – по 3 доклада; Национальным исследовательским университетом информационных технологий, механики и оптики, Институт белка, Уральским федеральным университетом, Казанским федеральным университетом, Санкт-Петербургским государственным политехническим университетом, Российским государственным национальным исследовательским университетом имени Н.И. Пирогова – по 2 доклада. По одному докладу на постерной сессии представили следующие научно-исследовательские институты и университеты: Новосибирский институт органической химии имени Н.Н. Ворожцова, Волгоградский государственный медицинский университет, Институт органической химии имени Н.Д. Зелинского, Институт цитологии и генетики, Институт экологии человека и охраны окружающей среды имени А.Н. Сысина, Всероссийский институт научной и технической информации, Институт общей и неорганической химии имени Н.С. Курнакова, Санкт-Петербургский государственный университет, Институт органической и физической химии имени А.Е. Арбузова, Институт полиомиэлита и вирусных энцефалитов имени М.П. Чумакова, Университет дружбы народов, Институт водных проблем, Башкирский государственный университет, Башкирский государственный медицинский университет, Институт новых антибиотиков имени Г.Ф. Гаузе, Научно-исследовательский институт физической и органической химии Южного федерального университета.

Отдельно следует упомянуть состоявшийся в рамках симпозиума Круглый стол по теме «Европейские инициативы в области (Q)SAR» в рамках официальных мероприятий Года науки Россия-ЕС 2014. На круглом столе с докладами выступили: Рональд Франк (ФМП, Берлин, Германия) «EU-Openscreen: Европейский ресурс и инфраструктура для поддержки исследований в области химической биологии», Ферран Санс (Университет Помпеу Фабра, Барселона, Испания) «eTOX: Интегральные стратегии для предсказания токсичности лекарств», Герхард Эккер (Венский университет, Вена, Австрия) «Проект Open PHACTS», и Мария Пуцелева (Представительство ЕС в России) «Европейская научная программа Горизонт-2020». В рамках дискуссии я рассказал о своем опыте участия в трех проектах Европейских научных программ FP6 и FP7. К сожалению, в отличие от реализованных ранее совместных проектов в рамках Европейских научных программ FP6 и FP7, проекты в рамках Европейской инициативы по созданию инфраструктуры для поиска и разработки инновационных лекарств (IMI) исключают участие в них российских научных организаций, а в рамках новой Европейской научной программы «Horison-2020» участие российских научных организаций возможно, но при условии раздельного финансирования работ организаций-резидентов Европейской Комиссией и Россией.